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using System; using System.Windows.Forms ; using System.Collections ; namespace Interpreter { /// /// Summary descripti…
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import java.io.*; import java.util.*; class DataReaderMultiAlpha { BufferedReader reader; ModelMaker modelmaker; …
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/* the idea is that if there is only one alphabet, the hmm is saved in the * original one-alphabet format, if there are 2-4 alpha…
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class MatchColumnIdentifyer { MSA msa; public MatchColumnIdentifyer(MSA msa) { this.msa = msa; } pu…
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import java.io.*; import java.util.*; class DataReader { BufferedReader reader; ModelMaker modelmaker; pub…
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import java.io.*; import java.util.*; class ProfileCreator { BufferedReader reader; ModelMaker modelmaker; Stri…