DNA序列比对

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针对DNA 片段拼接中的重复序列识别及屏蔽问题,提出一种预归并重复序列屏蔽方法。在片段拼接前通过扫描子串标识出可能存在重叠关系的shotgun 片段,利用子串归并该相关片段,标识出重复序列的位置信息,

2024-04-05 4 DNA序列比对

摘 要: 提出了一种新的测序纠错算法.该算法在对测序数据拼接之前对其进行检查,找出并修正测序序列中 的错误.该算法将测序数据映射成欧拉超路,并通过一种称为合并变换的等价变换,通过一系列规则的限制和引 导,动态地对欧拉超路进行简化.在...

2023-11-02 7 DNA序列比对

基于基因电脑克隆软件SiClone 和可变剪接分析软件AltSplice 的并行优化工作,提出一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案。该方案对所要进行比对分析的大规模序列库按某种策略进行分割部署,使

2024-01-16 3 DNA序列比对