gcgcheck.c

是有关基因比对的经典算法的实现。这对于初学计算生物学的人是非常重要的算法。

#include <ctype.h>   /* because of toupper() */
int SeqGCGCheckSum(char *seq, int len);

int SeqGCGCheckSum(char *seq, int len)
{
	int  i;
        long check;
        
        for( i=0, check=0; i< len; i++,seq++)
                check += ((i % 57)+1) * toupper(*seq);

        return(check % 10000);
}