weeviterbi_test.hmm

hmmer源程序

HMMER2.0
NAME  rrm
DESC  
LENG  72
ALPH  Amino
RF    no
CS    no
COM   hmmbuild weeviterbi_test.hmm /nfs/w4/Pfam/Seed/rrm.seed
NSEQ  70
DATE  Wed Mar  4 17:40:23 1998
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    24   -376  -4801   -143   1004  -1426    805    279  -1771    821  -1486  -3890   -527   2002    126     45   -287  -1679   -617  -4985  -4302 
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    25  -3608   -178  -1585  -1970    660  -5154  -4024   2773   -894   -985   -386  -4796  -1707  -4528  -4707   -609  -1823   2145  -3893  -1100 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -    -13 -11286 -12328   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    26   -673   -173  -3429   1042  -4598  -2161  -3110    535   1570      9    283   -508  -4517   -255    382  -1924    313   1407  -4706  -4127 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -    -13 -11286 -12328   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    27  -1211  -4799   1518    768  -5119  -1218   -441   -945  -1312  -2414   -587    909  -4396  -1010    534   1815     78   -487  -4983   -128 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
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    28   1271   2236  -5933  -5299    810  -2278   -651   1901  -1970   -221  -2639  -1497  -5203  -4524   -629   -638  -1577   1521  -3894  -1008 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -    -13 -11286 -12328   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    29  -1909  -4796    153    441  -1513  -4304   -599  -1894   1709     25  -3886    689  -1498    243   1438   -189   -879    380   -126   -255 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -    -13 -11286 -12329   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    30  -1277  -3441  -5893  -1776  -1155  -5147   -513   1829  -1993   1189   1888  -1484   -703  -4503  -1652  -1974  -3546   2209  -3898  -3554 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -    -14 -11287 -12329   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    31  -1299    746  -5893  -1992  -1190  -5147   -524   1691    424    -60   2330  -4774    111  -4503   -132    248  -1571   1419  -3898    -19 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -    -14 -11287 -12329   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    32  -3370  -4477  -3387     50   -560  -1979   -449    -51   1375   -681    233   1068    701  -1040   1343  -1845    543   -480    -10   1246 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -   -240 -11287  -2797   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    33  -3122  -4595   3395   -593  -4916  -1399    589  -1433    360  -4611   -290    780  -1313     35  -1369  -1782  -3061  -1712  -4778  -4095 
     -   -151   -504    236     42   -380    396    122   -618    211   -468   -714    274    392     45     98    355    123   -373   -299   -248 
     -   -841  -2976  -1709  -1966   -426  -3668   -118      *      * 
    34   -452  -4116   -568   -735  -4435  -1350  -2280  -1270   1458  -4131    792  -2257   1620    415   1996    479   -765  -1327  -4300   -538 
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249