fn3.hmm

这是一个基于HMM 模型的生物多序列比对算法的linux实现版本。hmmer

    56  -1241  -4929    424   -414    -37   -713   1149   -537   -799  -2452    153   1422  -1051   -431    507    353   1641  -1262  -5114    735    83
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    73  -1872  -5834  -9025  -8676  -1056  -8881  -8673   1755  -8630    359  -1237  -8541  -8490  -8319  -8674  -8265  -6337   3280  -7727  -7464   102
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     -    -42  -5742  -6616    -86  -4119   -701  -1378      *      * 
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     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -     -1 -11948 -12990   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
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     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -    -14 -11948  -6747   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
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     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
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    80  -1113  -4530  -1626   -702  -1338   3243  -3172  -4385  -2856  -2220  -3677  -1218  -4564  -2783  -3335   -609    475  -4087  -4819    473   110
     -   -153   -500    231     50   -364    398     93   -624    206   -464   -733    283    383     46     94    356    116   -368   -250   -237 
     -  -6367    -18 -12245   -485  -1807  -3943    -97      *      * 
    81  -5380  -6068  -5956  -5195  -7389   3194   -752  -6800  -1418  -2482  -5840  -5064   -706  -4120  -1351   1839  -5345  -6386  -6418  -6291   116
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -     -1 -11248 -12290   -894  -1115   -270  -2549      *      * 
    82     55  -5343   -399    930  -1066    -48   1295  -2492     90  -1643   1044   -891   1912   1116    368  -1154   -891  -1051  -5526  -1841   117
     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -     -1 -11854 -12896   -894  -1115   -101  -3893      *      * 
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     -   -149   -500    233     43   -381    399    106   -626    210   -466   -720    275    394     45     96    359    117   -369   -294   -249 
     -     -1 -11948 -12990   -894  -1115   -701  -1378      *      * 
    84  -1223  -5446  -3828  -1467  -5768   -863   -152  -2326  -1293  -5461  -4537  -3588  -2253  -1611   -424   3277    371  -5069  -5628  -4949   119
     -      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      *      * 
     -      *      *      *      *      *      *      *      *      0 
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