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来自「EM算法的改进」· ZOOPS 代码 · 共 476 行 · 第 1/3 页

RATRABGERB               (  139) GEIDTRFSFCAVATLALLGKLDAINVEKAIEFVLSCMNFDGGFGCRPGSE  1 
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 0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000 
 0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.500000  0.250000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.250000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000 
 0.250000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.250000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.250000  0.000000  0.250000  0.000000  0.000000 
 0.000000  0.000000  0.250000  0.750000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000  0.000000 
--------------------------------------------------------------------------------

--------------------------------------------------------------------------------
	Motif 2 regular expression
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GE[VI]D[TV]R[FGS][AISV][YF][CT]A[LAV][SA][AITV][AL][SAT][LI][LT][GN][IEK][LI][TD][AEPS][EDI][LNV][VFT][ED][GKP][ATV][AILV][EDN][FWY][VIL][LAK][KNRS]C[QMY]N[FWY][DE]GG[FI]G[CGLS][CRV]P[GHN][AMSV][ED]
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Time  3.32 secs.

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SUMMARY OF MOTIFS
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	Combined block diagrams: non-overlapping sites with p-value < 0.0001
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SEQUENCE NAME            COMBINED P-VALUE  MOTIF DIAGRAM
-------------            ----------------  -------------
RAM1_YEAST                       9.17e-64  205_[2(7.91e-45)]_36_[1(5.02e-27)]_108
PFTB_RAT                         8.05e-65  133_[1(5.98e-09)]_31_[2(9.82e-44)]_35_[1(3.39e-29)]_30_[1(5.70e-07)]_62
BET2_YEAST                       1.88e-70  31_[2(1.44e-05)]_50_[2(2.06e-44)]_37_[1(6.77e-34)]_17_[1(9.41e-07)]_26
RATRABGERB                       1.49e-67  42_[2(3.04e-09)]_46_[2(7.47e-43)]_34_[1(1.47e-32)]_17_[1(2.12e-07)]_28
CAL1_YEAST                       1.62e-25  212_[2(4.60e-06)]_8_[1(5.02e-27)]_20_[1(5.26e-05)]_22
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Stopped because nmotifs = 2 reached.
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CPU: chromo.imb.uq.edu.au

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