psiphi.input

emboss的linux版本的源代码

<a name="input.1"></a>
<h3>Input files for usage example </h3>
<p><h3>File: 1hmp_a.ccf</h3>
<table width="90%"><tr><td bgcolor="#FFCCFF">
<pre>
ID   1hmp_a
XX
DE   .
XX
OS   .
XX
EX   METHOD xray; RESO 2.50; NMOD 1; NCHN 1; NGRP 0;
XX
CN   [1]
XX
IN   ID A; NR 214; NL 0; NH 0; NE 0;
XX
SQ   SEQUENCE   214 AA;  24120 MW;  8D6FB467 CRC32;
     SPGVVISDDE PGYDLDLFCI PNHYAEDLER VFIPHGLIMD RTERLARDVM KEMGGHHIVA
     LCVLKGGYKF FADLLDYIKA LNRNSDRSIP MTVDFIRLKS YCNDQSTGDI KVIGGDDLST
     LTGKNVLIVE DIIDTGKTMQ TLLSLVRQYN PKMVKVASLL VKRTPRSVGY KPDFVGFEIP
     DKFVVGYALD YNEYFRDLNH VCVISETGKA KYKA
XX
CO   1    1    .    P    1     1     .    .    .    .    .    .    S    SER    N     51.993   53.717   25.698    1.00   37.54    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    1     1     .    .    .    .    .    .    S    SER    CA    52.814   53.824   24.502    1.00   41.16    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    1     1     .    .    .    .    .    .    S    SER    C     51.997   54.081   23.227    1.00   34.87    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    1     1     .    .    .    .    .    .    S    SER    O     50.959   53.486   23.008    1.00   33.66    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    1     1     .    .    .    .    .    .    S    SER    CB    53.743   52.616   24.334    1.00   49.66    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    1     1     .    .    .    .    .    .    S    SER    OG    54.029   52.378   22.957    1.00   53.87    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    2     2     .    .    .    .    .    .    P    PRO    N     52.447   55.004   22.388    1.00   33.37    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    2     2     .    .    .    .    .    .    P    PRO    CA    51.763   55.264   21.128    1.00   33.39    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    2     2     .    .    .    .    .    .    P    PRO    C     52.425   54.401   20.066    1.00   27.66    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    2     2     .    .    .    .    .    .    P    PRO    O     52.291   54.590   18.851    1.00   28.29    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    2     2     .    .    .    .    .    .    P    PRO    CB    52.034   56.746   20.799    1.00   35.05    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    2     2     .    .    .    .    .    .    P    PRO    CG    53.162   57.218   21.727    1.00   34.02    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    2     2     .    .    .    .    .    .    P    PRO    CD    53.218   56.209   22.865    1.00   33.44    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    3     3     .    .    .    .    .    .    G    GLY    N     53.208   53.487   20.565    1.00   20.99    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    3     3     .    .    .    .    .    .    G    GLY    CA    53.980   52.705   19.675    1.00   22.46    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    3     3     .    .    .    .    .    .    G    GLY    C     54.958   53.659   19.030    1.00   16.09    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    3     3     .    .    .    .    .    .    G    GLY    O     55.205   54.766   19.512    1.00   20.19    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    4     4     .    .    .    .    .    .    V    VAL    N     55.506   53.240   17.948    1.00   10.04    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    4     4     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CA    56.416   54.088   17.282    1.00   15.89    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    4     4     .    .    .    .    .    .    V    VAL    C     55.625   55.088   16.453    1.00   17.74    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    4     4     .    .    .    .    .    .    V    VAL    O     54.828   54.675   15.629    1.00   15.36    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    4     4     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CB    57.332   53.194   16.451    1.00   18.65    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    4     4     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CG1   58.444   53.988   15.754    1.00   18.67    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    4     4     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CG2   57.922   52.084   17.346    1.00   13.73    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    5     5     .    .    .    .    .    .    V    VAL    N     55.799   56.415   16.693    1.00   25.51    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    5     5     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CA    55.049   57.431   15.929    1.00   20.42    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    5     5     .    .    .    .    .    .    V    VAL    C     55.655   57.849   14.605    1.00   21.66    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    5     5     .    .    .    .    .    .    V    VAL    O     56.846   58.112   14.504    1.00   31.38    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    5     5     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CB    54.697   58.659   16.709    1.00   16.90    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    5     5     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CG1   54.131   59.664   15.699    1.00   19.06    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    5     5     .    .    .    .    .    .    V    VAL    CG2   53.640   58.304   17.738    1.00   14.10    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00
CO   1    1    .    P    6     6     .    .    .    .    .    .    I    ILE    N     54.810   57.974   13.593    1.00   20.18    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00