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来自「最著名最快的分子模拟软件」· C语言 代码 · 共 1,621 行 · 第 1/5 页
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dz12 = vec_sub(iz1,jz2); dz13 = vec_sub(iz1,jz3); dx21 = vec_sub(ix2,jx1); dx22 = vec_sub(ix2,jx2); dx23 = vec_sub(ix2,jx3); dy21 = vec_sub(iy2,jy1); dy22 = vec_sub(iy2,jy2); dy23 = vec_sub(iy2,jy3); dz21 = vec_sub(iz2,jz1); dz22 = vec_sub(iz2,jz2); dz23 = vec_sub(iz2,jz3); dx31 = vec_sub(ix3,jx1); dx32 = vec_sub(ix3,jx2); dx33 = vec_sub(ix3,jx3); dy31 = vec_sub(iy3,jy1); dy32 = vec_sub(iy3,jy2); dy33 = vec_sub(iy3,jy3); dz31 = vec_sub(iz3,jz1); dz32 = vec_sub(iz3,jz2); dz33 = vec_sub(iz3,jz3); rsq11 = vec_madd(dx11,dx11,nul); rsq12 = vec_madd(dx12,dx12,nul); rsq13 = vec_madd(dx13,dx13,nul); rsq21 = vec_madd(dx21,dx21,nul); rsq22 = vec_madd(dx22,dx22,nul); rsq23 = vec_madd(dx23,dx23,nul); rsq31 = vec_madd(dx31,dx31,nul); rsq32 = vec_madd(dx32,dx32,nul); rsq33 = vec_madd(dx33,dx33,nul); rsq11 = vec_madd(dy11,dy11,rsq11); rsq12 = vec_madd(dy12,dy12,rsq12); rsq13 = vec_madd(dy13,dy13,rsq13); rsq21 = vec_madd(dy21,dy21,rsq21); rsq22 = vec_madd(dy22,dy22,rsq22); rsq23 = vec_madd(dy23,dy23,rsq23); rsq31 = vec_madd(dy31,dy31,rsq31); rsq32 = vec_madd(dy32,dy32,rsq32); rsq33 = vec_madd(dy33,dy33,rsq33); rsq11 = vec_madd(dz11,dz11,rsq11); rsq12 = vec_madd(dz12,dz12,rsq12); rsq13 = vec_madd(dz13,dz13,rsq13); rsq21 = vec_madd(dz21,dz21,rsq21); rsq22 = vec_madd(dz22,dz22,rsq22); rsq23 = vec_madd(dz23,dz23,rsq23); rsq31 = vec_madd(dz31,dz31,rsq31); rsq32 = vec_madd(dz32,dz32,rsq32); rsq33 = vec_madd(dz33,dz33,rsq33); zero_highest_element_in_9_vectors(&rsq11,&rsq12,&rsq13, &rsq21,&rsq22,&rsq23, &rsq31,&rsq32,&rsq33); do_9_invsqrt(rsq11,rsq12,rsq13, rsq21,rsq22,rsq23, rsq31,rsq32,rsq33, &rinv11,&rinv12,&rinv13, &rinv21,&rinv22,&rinv23, &rinv31,&rinv32,&rinv33); zero_highest_element_in_9_vectors(&rinv11,&rinv12,&rinv13, &rinv21,&rinv22,&rinv23, &rinv31,&rinv32,&rinv33); krsq11 = vec_madd(vkrf,rsq11,nul); krsq12 = vec_madd(vkrf,rsq12,nul); krsq13 = vec_madd(vkrf,rsq13,nul); krsq21 = vec_madd(vkrf,rsq21,nul); krsq22 = vec_madd(vkrf,rsq22,nul); krsq23 = vec_madd(vkrf,rsq23,nul); krsq31 = vec_madd(vkrf,rsq31,nul); krsq32 = vec_madd(vkrf,rsq32,nul); krsq33 = vec_madd(vkrf,rsq33,nul); rinv11 = vec_add(rinv11,krsq11); rinv12 = vec_add(rinv12,krsq12); rinv13 = vec_add(rinv13,krsq13); rinv21 = vec_add(rinv21,krsq21); rinv22 = vec_add(rinv22,krsq22); rinv23 = vec_add(rinv23,krsq23); rinv31 = vec_add(rinv31,krsq31); rinv32 = vec_add(rinv32,krsq32); rinv33 = vec_add(rinv33,krsq33); rinv11 = vec_sub(rinv11,vcrf); rinv12 = vec_sub(rinv12,vcrf); rinv13 = vec_sub(rinv13,vcrf); rinv21 = vec_sub(rinv21,vcrf); rinv22 = vec_sub(rinv22,vcrf); rinv23 = vec_sub(rinv23,vcrf); rinv31 = vec_sub(rinv31,vcrf); rinv32 = vec_sub(rinv32,vcrf); rinv33 = vec_sub(rinv33,vcrf); vctot = vec_madd(qqHH,rinv11,vctot); vctot = vec_madd(qqHH,rinv12,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv13,vctot); vctot = vec_madd(qqHH,rinv21,vctot); vctot = vec_madd(qqHH,rinv22,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv23,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv31,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv32,vctot); vctot = vec_madd(qqMM,rinv33,vctot); } else if(k<(nj1-1)) { jnra = jjnr[k]; 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zero_highest_2_elements_in_9_vectors(&rinv11,&rinv12,&rinv13, &rinv21,&rinv22,&rinv23, &rinv31,&rinv32,&rinv33); krsq11 = vec_madd(vkrf,rsq11,nul); krsq12 = vec_madd(vkrf,rsq12,nul); krsq13 = vec_madd(vkrf,rsq13,nul); krsq21 = vec_madd(vkrf,rsq21,nul); krsq22 = vec_madd(vkrf,rsq22,nul); krsq23 = vec_madd(vkrf,rsq23,nul); krsq31 = vec_madd(vkrf,rsq31,nul); krsq32 = vec_madd(vkrf,rsq32,nul); krsq33 = vec_madd(vkrf,rsq33,nul); rinv11 = vec_add(rinv11,krsq11); rinv12 = vec_add(rinv12,krsq12); rinv13 = vec_add(rinv13,krsq13); rinv21 = vec_add(rinv21,krsq21); rinv22 = vec_add(rinv22,krsq22); rinv23 = vec_add(rinv23,krsq23); rinv31 = vec_add(rinv31,krsq31); rinv32 = vec_add(rinv32,krsq32); rinv33 = vec_add(rinv33,krsq33); rinv11 = vec_sub(rinv11,vcrf); rinv12 = vec_sub(rinv12,vcrf); rinv13 = vec_sub(rinv13,vcrf); rinv21 = vec_sub(rinv21,vcrf); rinv22 = vec_sub(rinv22,vcrf); rinv23 = vec_sub(rinv23,vcrf); rinv31 = vec_sub(rinv31,vcrf); rinv32 = vec_sub(rinv32,vcrf); rinv33 = vec_sub(rinv33,vcrf); vctot = vec_madd(qqHH,rinv11,vctot); vctot = vec_madd(qqHH,rinv12,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv13,vctot); vctot = vec_madd(qqHH,rinv21,vctot); vctot = vec_madd(qqHH,rinv22,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv23,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv31,vctot); vctot = vec_madd(qqMH,rinv32,vctot); vctot = vec_madd(qqMM,rinv33,vctot); } else if(k<nj1) { jnra = jjnr[k]; j3a = 3*jnra; load_1_3atoms(pos+j3a+3, &jx1,&jy1,&jz1,&jx2,&jy2,&jz2,&jx3,&jy3,&jz3); qqMMt = vec_sld(qqMM,nul,12); qqMHt = vec_sld(qqMH,nul,12); qqHHt = vec_sld(qqHH,nul,12); dx11 = vec_sub(ix1,jx1); dx12 = vec_sub(ix1,jx2); dx13 = vec_sub(ix1,jx3); dy11 = vec_sub(iy1,jy1); dy12 = vec_sub(iy1,jy2); dy13 = vec_sub(iy1,jy3); dz11 = vec_sub(iz1,jz1); dz12 = vec_sub(iz1,jz2); dz13 = vec_sub(iz1,jz3); dx21 = vec_sub(ix2,jx1); dx22 = vec_sub(ix2,jx2); dx23 = vec_sub(ix2,jx3); dy21 = vec_sub(iy2,jy1); dy22 = vec_sub(iy2,jy2); dy23 = vec_sub(iy2,jy3); dz21 = vec_sub(iz2,jz1); dz22 = vec_sub(iz2,jz2); dz23 = vec_sub(iz2,jz3); dx31 = vec_sub(ix3,jx1); dx32 = vec_sub(ix3,jx2); dx33 = vec_sub(ix3,jx3); dy31 = vec_sub(iy3,jy1); dy32 = vec_sub(iy3,jy2); dy33 = vec_sub(iy3,jy3); dz31 = vec_sub(iz3,jz1); dz32 = vec_sub(iz3,jz2); dz33 = vec_sub(iz3,jz3); rsq11 = vec_madd(dx11,dx11,nul); rsq12 = vec_madd(dx12,dx12,nul); rsq13 = vec_madd(dx13,dx13,nul); rsq21 = vec_madd(dx21,dx21,nul); rsq22 = vec_madd(dx22,dx22,nul); rsq23 = vec_madd(dx23,dx23,nul); rsq31 = vec_madd(dx31,dx31,nul); rsq32 = vec_madd(dx32,dx32,nul); rsq33 = vec_madd(dx33,dx33,nul); rsq11 = vec_madd(dy11,dy11,rsq11); rsq12 = vec_madd(dy12,dy12,rsq12); rsq13 = vec_madd(dy13,dy13,rsq13); rsq21 = vec_madd(dy21,dy21,rsq21); rsq22 = vec_madd(dy22,dy22,rsq22); rsq23 = vec_madd(dy23,dy23,rsq23); rsq31 = vec_madd(dy31,dy31,rsq31); rsq32 = vec_madd(dy32,dy32,rsq32); rsq33 = vec_madd(dy33,dy33,rsq33); rsq11 = vec_madd(dz11,dz11,rsq11); rsq12 = vec_madd(dz12,dz12,rsq12); rsq13 = vec_madd(dz13,dz13,rsq13); rsq21 = vec_madd(dz21,dz21,rsq21); rsq22 = vec_madd(dz22,dz22,rsq22); rsq23 = vec_madd(dz23,dz23,rsq23); 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