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来自「最著名最快的分子模拟软件」· C语言 代码 · 共 1,579 行 · 第 1/5 页
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fiy1 = vec_madd(fs13,dy13,fiy1); fiz1 = vec_madd(fs13,dz13,fiz1); fix2 = vec_madd(fs23,dx23,fix2); fiy2 = vec_madd(fs23,dy23,fiy2); fiz2 = vec_madd(fs23,dz23,fiz2); fix3 = vec_madd(fs33,dx33,fix3); fiy3 = vec_madd(fs33,dy33,fiy3); fiz3 = vec_madd(fs33,dz33,fiz3); fjx1 = vec_nmsub(fs11,dx11,nul); fjy1 = vec_nmsub(fs11,dy11,nul); fjz1 = vec_nmsub(fs11,dz11,nul); fjx2 = vec_nmsub(fs12,dx12,nul); fjy2 = vec_nmsub(fs12,dy12,nul); fjz2 = vec_nmsub(fs12,dz12,nul); fjx3 = vec_nmsub(fs13,dx13,nul); fjy3 = vec_nmsub(fs13,dy13,nul); fjz3 = vec_nmsub(fs13,dz13,nul); fjx1 = vec_nmsub(fs21,dx21,fjx1); fjy1 = vec_nmsub(fs21,dy21,fjy1); fjz1 = vec_nmsub(fs21,dz21,fjz1); fjx2 = vec_nmsub(fs22,dx22,fjx2); fjy2 = vec_nmsub(fs22,dy22,fjy2); fjz2 = vec_nmsub(fs22,dz22,fjz2); fjx3 = vec_nmsub(fs23,dx23,fjx3); fjy3 = vec_nmsub(fs23,dy23,fjy3); fjz3 = vec_nmsub(fs23,dz23,fjz3); fjx1 = vec_nmsub(fs31,dx31,fjx1); fjy1 = vec_nmsub(fs31,dy31,fjy1); fjz1 = vec_nmsub(fs31,dz31,fjz1); fjx2 = vec_nmsub(fs32,dx32,fjx2); fjy2 = vec_nmsub(fs32,dy32,fjy2); fjz2 = vec_nmsub(fs32,dz32,fjz2); fjx3 = vec_nmsub(fs33,dx33,fjx3); fjy3 = vec_nmsub(fs33,dy33,fjy3); fjz3 = vec_nmsub(fs33,dz33,fjz3); add_force_to_4_3atoms(faction+j3a,faction+j3b, faction+j3c,faction+j3d, fjx1,fjy1,fjz1,fjx2,fjy2,fjz2, fjx3,fjy3,fjz3); } if(k<(nj1-2)) { jnra = jjnr[k]; jnrb = jjnr[k+1]; jnrc = jjnr[k+2]; j3a = 3*jnra; j3b = 3*jnrb; j3c = 3*jnrc; load_3_3atoms(pos+j3a,pos+j3b,pos+j3c, &jx1,&jy1,&jz1,&jx2,&jy2,&jz2,&jx3,&jy3,&jz3); qqOOt = vec_sld(qqOO,nul,4); qqOHt = vec_sld(qqOH,nul,4); qqHHt = vec_sld(qqHH,nul,4); c6t = vec_sld(c6,nul,4); c12t = vec_sld(c12,nul,4); dx11 = vec_sub(ix1,jx1); dx12 = vec_sub(ix1,jx2); dx13 = vec_sub(ix1,jx3); dy11 = vec_sub(iy1,jy1); dy12 = vec_sub(iy1,jy2); dy13 = vec_sub(iy1,jy3); dz11 = vec_sub(iz1,jz1); dz12 = vec_sub(iz1,jz2); dz13 = vec_sub(iz1,jz3); dx21 = vec_sub(ix2,jx1); dx22 = vec_sub(ix2,jx2); dx23 = vec_sub(ix2,jx3); dy21 = vec_sub(iy2,jy1); dy22 = vec_sub(iy2,jy2); dy23 = vec_sub(iy2,jy3); dz21 = vec_sub(iz2,jz1); dz22 = vec_sub(iz2,jz2); dz23 = vec_sub(iz2,jz3); dx31 = vec_sub(ix3,jx1); dx32 = vec_sub(ix3,jx2); dx33 = vec_sub(ix3,jx3); dy31 = vec_sub(iy3,jy1); dy32 = vec_sub(iy3,jy2); dy33 = vec_sub(iy3,jy3); dz31 = vec_sub(iz3,jz1); dz32 = vec_sub(iz3,jz2); dz33 = vec_sub(iz3,jz3); rsq11 = vec_madd(dx11,dx11,nul); rsq12 = vec_madd(dx12,dx12,nul); rsq13 = vec_madd(dx13,dx13,nul); rsq21 = vec_madd(dx21,dx21,nul); rsq22 = vec_madd(dx22,dx22,nul); rsq23 = vec_madd(dx23,dx23,nul); rsq31 = vec_madd(dx31,dx31,nul); rsq32 = vec_madd(dx32,dx32,nul); rsq33 = vec_madd(dx33,dx33,nul); rsq11 = vec_madd(dy11,dy11,rsq11); rsq12 = vec_madd(dy12,dy12,rsq12); rsq13 = vec_madd(dy13,dy13,rsq13); rsq21 = vec_madd(dy21,dy21,rsq21); rsq22 = vec_madd(dy22,dy22,rsq22); rsq23 = vec_madd(dy23,dy23,rsq23); rsq31 = vec_madd(dy31,dy31,rsq31); rsq32 = vec_madd(dy32,dy32,rsq32); rsq33 = vec_madd(dy33,dy33,rsq33); rsq11 = vec_madd(dz11,dz11,rsq11); rsq12 = vec_madd(dz12,dz12,rsq12); rsq13 = vec_madd(dz13,dz13,rsq13); rsq21 = vec_madd(dz21,dz21,rsq21); rsq22 = vec_madd(dz22,dz22,rsq22); rsq23 = vec_madd(dz23,dz23,rsq23); rsq31 = vec_madd(dz31,dz31,rsq31); rsq32 = vec_madd(dz32,dz32,rsq32); rsq33 = vec_madd(dz33,dz33,rsq33); zero_highest_element_in_9_vectors(&rsq11,&rsq12,&rsq13, &rsq21,&rsq22,&rsq23, &rsq31,&rsq32,&rsq33); do_9_invsqrt(rsq11,rsq12,rsq13, rsq21,rsq22,rsq23, rsq31,rsq32,rsq33, &rinv11,&rinv12,&rinv13, &rinv21,&rinv22,&rinv23, &rinv31,&rinv32,&rinv33); zero_highest_element_in_9_vectors(&rinv11,&rinv12,&rinv13, &rinv21,&rinv22,&rinv23, &rinv31,&rinv32,&rinv33); rinvsq11 = vec_madd(rinv11,rinv11,nul); r11 = vec_madd(rsq11,rinv11,nul); r12 = vec_madd(rsq12,rinv12,nul); r13 = vec_madd(rsq13,rinv13,nul); r21 = vec_madd(rsq21,rinv21,nul); rinvsix = vec_madd(rinvsq11,rinvsq11,nul); r22 = vec_madd(rsq22,rinv22,nul); r23 = vec_madd(rsq23,rinv23,nul); r31 = vec_madd(rsq31,rinv31,nul); r32 = vec_madd(rsq32,rinv32,nul); r33 = vec_madd(rsq33,rinv33,nul); rinvsix = vec_madd(rinvsix,rinvsq11,nul); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r11,tsc,nul),&VV11c,&FF11c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r12,tsc,nul),&VV12c,&FF12c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r13,tsc,nul),&VV13c,&FF13c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r21,tsc,nul),&VV21c,&FF21c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r22,tsc,nul),&VV22c,&FF22c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r23,tsc,nul),&VV23c,&FF23c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r31,tsc,nul),&VV31c,&FF31c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r32,tsc,nul),&VV32c,&FF32c); do_3_ctable_coul(VFtab,vec_madd(r33,tsc,nul),&VV33c,&FF33c); Vvdw6 = vec_madd(c6t,rinvsix,nul); Vvdw12 = vec_madd(c12t,vec_madd(rinvsix,rinvsix,nul), nul); fs11 = vec_madd(vec_twelve(),Vvdw12,nul); fs11c = vec_nmsub(qqOOt,FF11c,nul); fs12 = vec_nmsub(qqOHt,FF12c,nul); fs13 = vec_nmsub(qqOHt,FF13c,nul); fs21 = vec_nmsub(qqOHt,FF21c,nul); fs11 = vec_nmsub(vec_six(),Vvdw6,fs11); fs22 = vec_nmsub(qqHHt,FF22c,nul); fs23 = vec_nmsub(qqHHt,FF23c,nul); fs31 = vec_nmsub(qqOHt,FF31c,nul); fs32 = vec_nmsub(qqHHt,FF32c,nul); fs11 = vec_madd(fs11,rinv11,nul); fs33 = vec_nmsub(qqHHt,FF33c,nul); Vvdwtot = vec_add(Vvdwtot,Vvdw12); Vvdwtot = vec_sub(Vvdwtot,Vvdw6); vctot = vec_madd(qqOOt,VV11c,vctot); vctot = vec_madd(qqOHt,VV12c,vctot); vctot = vec_madd(qqOHt,VV13c,vctot); vctot = vec_madd(qqOHt,VV21c,vctot); vctot = vec_madd(qqHHt,VV22c,vctot); vctot = vec_madd(qqHHt,VV23c,vctot); vctot = vec_madd(qqOHt,VV31c,vctot); vctot = vec_madd(qqHHt,VV32c,vctot); vctot = vec_madd(qqHHt,VV33c,vctot); fs11 = vec_madd(fs11c,tsc,fs11); fs12 = vec_madd(fs12,tsc,nul); fs13 = vec_madd(fs13,tsc,nul); fs21 = vec_madd(fs21,tsc,nul); fs22 = vec_madd(fs22,tsc,nul); fs23 = vec_madd(fs23,tsc,nul); fs31 = vec_madd(fs31,tsc,nul); fs32 = vec_madd(fs32,tsc,nul); fs33 = vec_madd(fs33,tsc,nul); fs11 = vec_madd(fs11,rinv11,nul); fs12 = vec_madd(fs12,rinv12,nul); fs13 = vec_madd(fs13,rinv13,nul); fs21 = vec_madd(fs21,rinv21,nul); fs22 = vec_madd(fs22,rinv22,nul); fs23 = vec_madd(fs23,rinv23,nul); fs31 = vec_madd(fs31,rinv31,nul); fs32 = vec_madd(fs32,rinv32,nul); fs33 = vec_madd(fs33,rinv33,nul); fix1 = vec_madd(fs11,dx11,fix1); fiy1 = vec_madd(fs11,dy11,fiy1); fiz1 = vec_madd(fs11,dz11,fiz1); fix2 = vec_madd(fs21,dx21,fix2); fiy2 = vec_madd(fs21,dy21,fiy2); fiz2 = vec_madd(fs21,dz21,fiz2); fix3 = vec_madd(fs31,dx31,fix3); fiy3 = vec_madd(fs31,dy31,fiy3); fiz3 = vec_madd(fs31,dz31,fiz3); fix1 = vec_madd(fs12,dx12,fix1); fiy1 = vec_madd(fs12,dy12,fiy1); fiz1 = vec_madd(fs12,dz12,fiz1); fix2 = vec_madd(fs22,dx22,fix2); fiy2 = vec_madd(fs22,dy22,fiy2); fiz2 = vec_madd(fs22,dz22,fiz2); fix3 = vec_madd(fs32,dx32,fix3); fiy3 = vec_madd(fs32,dy32,fiy3); fiz3 = vec_madd(fs32,dz32,fiz3); fix1 = vec_madd(fs13,dx13,fix1); fiy1 = vec_madd(fs13,dy13,fiy1); fiz1 = vec_madd(fs13,dz13,fiz1); fix2 = vec_madd(fs23,dx23,fix2); fiy2 = vec_madd(fs23,dy23,fiy2); fiz2 = vec_madd(fs23,dz23,fiz2); fix3 = vec_madd(fs33,dx33,fix3); fiy3 = vec_madd(fs33,dy33,fiy3); fiz3 = vec_madd(fs33,dz33,fiz3); fjx1 = vec_nmsub(fs11,dx11,nul); fjy1 = vec_nmsub(fs11,dy11,nul); fjz1 = vec_nmsub(fs11,dz11,nul); fjx2 = vec_nmsub(fs12,dx12,nul); fjy2 = vec_nmsub(fs12,dy12,nul); fjz2 = vec_nmsub(fs12,dz12,nul); fjx3 = vec_nmsub(fs13,dx13,nul); fjy3 = vec_nmsub(fs13,dy13,nul); fjz3 = vec_nmsub(fs13,dz13,nul); fjx1 = vec_nmsub(fs21,dx21,fjx1); fjy1 = vec_nmsub(fs21,dy21,fjy1); fjz1 = vec_nmsub(fs21,dz21,fjz1); fjx2 = vec_nmsub(fs22,dx22,fjx2); fjy2 = vec_nmsub(fs22,dy22,fjy2); fjz2 = vec_nmsub(fs22,dz22,fjz2); fjx3 = vec_nmsub(fs23,dx23,fjx3); fjy3 = vec_nmsub(fs23,dy23,fjy3); fjz3 = vec_nmsub(fs23,dz23,fjz3); fjx1 = vec_nmsub(fs31,dx31,fjx1); fjy1 = vec_nmsub(fs31,dy31,fjy1); fjz1 = vec_nmsub(fs31,dz31,fjz1); fjx2 = vec_nmsub(fs32,dx32,fjx2); fjy2 = vec_nmsub(fs32,dy32,fjy2); fjz2 = vec_nmsub(fs32,dz32,fjz2); fjx3 = vec_nmsub(fs33,dx33,fjx3); fjy3 = vec_nmsub(fs33,dy33,fjy3); fjz3 = vec_nmsub(fs33,dz33,fjz3); add_force_to_3_3atoms(faction+j3a,faction+j3b,faction+j3c, fjx1,fjy1,fjz1,fjx2,fjy2,fjz2, fjx3,fjy3,fjz3); } else if(k<(nj1-1)) { jnra = jjnr[k]; jnrb = jjnr[k+1]; j3a = 3*jnra; j3b = 3*jnrb; load_2_3atoms(pos+j3a,pos+j3b, &jx1,&jy1,&jz1,&jx2,&jy2,&jz2,&jx3,&jy3,&jz3); qqOOt = vec_sld(qqOO,nul,8); qqOHt = vec_sld(qqOH,nul,8); qqHHt = vec_sld(qqHH,nul,8); c6t = vec_sld(c6,nul,8); c12t = vec_sld(c12,nul,8); dx11 = vec_sub(ix1,jx1); dx12 = vec_sub(ix1,jx2); dx13 = vec_sub(ix1,jx3); dy11 = vec_sub(iy1,jy1); dy12 = vec_sub(iy1,jy2); dy13 = vec_sub(iy1,jy3); dz11 = vec_sub(iz1,jz1); dz12 = vec_sub(iz1,jz2); dz13 = vec_sub(iz1,jz3); dx21 = vec_sub(ix2,jx1); dx22 = vec_sub(ix2,jx2); dx23 = vec_sub(ix2,jx3); dy21 = vec_sub(iy2,jy1); dy22 = vec_sub(iy2,jy2); dy23 = vec_sub(iy2,jy3); dz21 = vec_sub(iz2,jz1); dz22 = vec_sub(iz2,jz2); dz23 = vec_sub(iz2,jz3); dx31 = vec_sub(ix3,jx1); dx32 = vec_sub(ix3,jx2); dx33 = vec_sub(ix3,jx3); dy31 = vec_sub(iy3,jy1); dy32 = vec_sub(iy3,jy2); dy33 = vec_sub(iy3,jy3); dz31 = vec_sub(iz3,jz1); dz32 = vec_sub(iz3,jz2); dz33 = vec_sub(iz3,jz3); rsq11 = vec_madd(dx11,dx11,nul); rsq12 = vec_madd(dx12,dx12,nul); rsq13 = vec_madd(dx13,dx13,nul); rsq21 = vec_madd(dx21,dx21,nul); rsq22 = vec_madd(dx22,dx22,nul); rsq23 = vec_madd(dx23,dx23,nul); rsq31 = vec_madd(dx31,dx31,nul); rsq32 = vec_madd(dx32,dx32,nul); rsq33 = vec_madd(dx33,dx33,nul); rsq11 = vec_madd(dy11,dy11,rsq11); rsq12 = vec_madd(dy12,dy12,rsq12); rsq13 = vec_madd(dy13,dy13,rsq13);⌨️ 快捷键说明
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