complexity03.htm

《复杂》一书可以说是学习复杂系统、Agent建模技术、人工生命科学的一本必读的Bible。

  auto;text-indent:21.0pt;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><b><span
  style='font-size:12.0pt'>秩序<span lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></b></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>走在世界上任何一个科学研究所的走廊上，你会很容易就透过一个办公室敞开的门看到墙上贴着一幅爱因斯坦的画像：爱因斯坦裹着一件大衣，心不在焉地走在普林斯顿大学的雪地上；爱因斯坦神情专注地凝视着照相机镜头，破旧的毛衣领子上别着一支自来水笔；爱因斯坦咧开嘴大笑，对着全世界伸舌头。这个相对论的创立者几乎是大家共同的科学英雄，是深邃的思想和自由的创造精神的象征。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>在五十年代初，爱因斯坦当然是加利福尼亚州萨克拉门托的一个名叫斯图尔特·考夫曼的男孩心目中的英雄。“我极其崇拜爱因斯坦。不，不能用崇拜这个词，应该叫热爱。我热爱他把理论看作是人类心智自由创造的思想，我热爱他视科学为对造物主秘密的探究。”爱因斯坦用<span
  lang=EN-US>OldOne</span>来比喻宇宙的创造者。考夫曼对<span lang=EN-US>1954</span>年第一次接触到爱因斯坦的思想仍然记忆犹新。那时他才十五岁，读到一本爱因斯坦和他的合作者雷奥波德·英费尔德（<span
  lang=EN-US>LeopoldInfeld</span>）合写的一本关于相对论起源的普及读物。“当时我为能够看懂这本书，或我以为我能看懂这本书而激动万分。爱因斯坦巨大的创造力和自由驰骋的思维使他能够在他自己的头脑中创造出一个世界来。我记得我当时想，有人能这样做简直太美妙了。我记得他去世的时候（<span
  lang=EN-US>1955</span>年）我哭了。我感到就像失去了一位老朋友。”<span lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>在读到这本书之前，考夫曼即使不是个引人注目的学生，也一直是个不是拿<span
  lang=EN-US>A</span>就是拿<span lang=EN-US>B</span>的好学生。但在这之后，他的热情被点燃了，倒不一定是被科学点燃的。他不觉得他必须亦步亦趋地跟随爱因斯坦的脚步走。但毫无疑问他感到有了一种与爱因斯坦同样的想洞容事物内部秘密的欲望。“当你观看一幅立体派油画，看到上面隐在的结构——那就是我想探索的。”事实上，他对此表现出来的最直接的兴趣根本就不是在科学方面。少年时期的考夫曼热衷于当个剧作家，探测人类灵魂里的黑暗和光明。他的第一部作品，和他高中时的英语教师弗莱德·托德合作写的一个音乐剧本简直“糟糕透顶”。但他对被一个真正的大人很当回事地来对待而激动不已。那时托德二十四岁，与托德的合作是启发考夫曼的知识觉醒的很关键的一步。“尽管那不是一部很好的音乐剧，但如果我十六岁时就能和弗莱德合作写出一部音乐剧来，那还有什么不能做到呢？”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>所以当斯图尔特·考夫曼<span lang=EN-US>1957</span>年进入达特茅斯时，他已经完完全全是一个剧作家了。他甚至还抽烟斗，因为他的一个朋友告诉他，如果你想成为一个剧作家的话，你就必须会用烟斗抽烟。当然，他继续写剧本：他与他大学一年级的同屋、高中开始的小伙伴麦克·迈格雷合作，又写了三部剧。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>但很快，考夫曼就发现他创作的剧本的问题：剧中人物发表许多武断的意见。“他们喋喋不休地探讨生命的意义和怎样才算一个好人。他们只是谈论这些，却没有行动。”他开始意识到，他对剧本本身的兴趣远不如对他剧本中的人物想探索的思想要大。“我想寻找到通往某种隐在的强大而神奇的东西的通道——虽然我说不清楚那究竟是什么。当我发现我的好朋友狄克·格林将要去哈佛大学攻读哲学时，我感到非常懊恼。我希望我也能够成为一个哲学家。但我当然只能做一个剧作家。放弃做一个剧作家，就意味着放弃我正在为自己设想的身份。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>他回忆说，他思想斗争了一个星期才想透彻：“我不一定非要当一个剧作家，我可以成为一个哲学家！所以在后来的六年中，我以极大的热情投入到对哲学的研究之中。”当然，他从伦理学开始学起。作为一个剧作家，他想弄明白善与恶的问题。除此之外，作为一个哲学家他还能学点别的什么呢？但很快他就发现自己又喜欢上了别的东西。他的兴趣转移到了科学的哲学和思维的哲学上来了。他说：“对我来说，它们似乎是深透之所在。”什么是可以用来发现世界本质的科学？什么可以用来了解世界的心智的科学？<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>在这股求知热情的驱使下，考夫曼在<span
  lang=EN-US>1961</span>年以第三名的成绩毕业于达特茅斯大学，继而又获得了牛津大学<span lang=EN-US>1961</span>年至<span
  lang=EN-US>1963</span>年的马歇尔奖学金。结果，他没有直接去牛津大学。“在必须到牛津报到之前我有八个月的时间，所以我做了唯一的一件理性的事情：我买了一辆大众车，开着它到阿尔卑斯山去滑雪。我有奥地利圣·安东最尊贵的地址，波斯特旅馆。我把车停放在旅馆的停车场，整个冬天都使用那个旅馆的盥洗室。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>他一到牛津就发现这儿的环境非常适宜于他。他至今仍然能够数出他这一生中最使他激动的三个学术环境，牛津便是第一个。“我生平第一次发现我周围的人都比我聪明。美国人在那里也是人才济济。有罗德奖学金获得者，马歇尔奖学金获得者。其中有些人已是很知名的人物了。那时和我们一批的莫德林学院的（<span
  lang=EN-US>Magdalene</span>）戴维·苏特（<span lang=EN-US>David Souter</span>），现在供职于最高法院。乔治·<span
  lang=EN-US>F</span>．威尔（<span lang=EN-US>Geofge F Will</span>，美国著名新闻评论家及专栏作家）和我曾经总是去吃印度餐厅，逃避学院的伙食。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>对科学与思维的强烈求知欲使考夫曼在牛津选择了哲学、心理学及生理学课程。这些课程不仅只包括传统哲学，而且更注重当代对视觉系统的神经分析和对脑部神经联系的更为广泛的模拟。总之，这门课致力于从科学的角度来研究思维的运作。他的心理学导师名叫斯图尔特·苏瑟兰德（<span
  lang=EN-US>Stuart Sutherland</span>），他后来成为又一位很有影响的人物。苏瑟兰德喜欢坐在他的书桌后面，连续不断地把问题抛给他的学生，让他们做思考体操：“考夫曼！视觉系统是怎样区分投射到视网膜相邻的两个锥体上的两个光点的？”考夫曼发现他喜欢面对这类富有挑战性的问题。他发现他有能力当场想出各种方案，作出有说服力的回答。（“嗯，眼睛并不是静止不动的，它在轻轻移动。所以，也许当你刺激多个视网杆和视网膜时……”）确实，他承认这样即兴建立模型使他养成了一种习惯。从此以后，他一直在或这样或那样地即兴建立模型。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>但是，他也不得不承认，不无讽刺的是，正是这种可以即兴建立模型的能力使他放弃了哲学，趋向某种更为切合实际的方向：医学院。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>他笑着说：“在某种程度上，我认为我永远也不可能成为一个伟大的哲学家。我的论点是：我永远也不会有康德那么聪明。而除非你能像康德那么聪明，否则成为一个哲学家就没有什么意义。所以我应该去读医学院。你会注意到，这不是一个推理。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>当真地说，其实是因为他那时对哲学感到厌烦了。他说：“这并不是说我不再热爱哲学了。而是我不相信哲学中的某种轻浮性。当代哲学家们，或起码是五十年代和六十年代的哲学家们，总认为自己是在检验概念和概念的意义，而不是在检验这个世界的现实。所以你可以发现你的论点是否中肯、是否得当、是否连贯等等，但却无法发现你是否正确。这最终引起了我的不满。”他希望做深入现实的探究，希望洞察造物主的奥秘。“如果可以选择，我情愿做爱因斯坦，而不做维特根斯坦（<span
  lang=EN-US>Ludwig Wittgenstein</span>，奥地利籍著名哲学家）”。<span lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>更重要的是，他不敢信任自己身上轻浮的弱点。“我始终非常擅长于概念性的东西。”他说。“往最好的说，这是我性格中最为深刻的一面，是上帝赐予我的天赋。但往最坏的说，这是圆滑取巧，是肤浅。因为我有这种焦虑，所以我对自己说：‘去读医学院吧。那些坏脾气的女人生的儿子们是不会让我光耍嘴皮子，到处卖弄知识的。因为我不得不照顾病人，他们会迫使我去了解大量的事实。’”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>事实确实如此。但不知为什么，医学院和病人并没有改变考夫曼喜欢玩思想的习惯。其实医学从来就不曾真正有机会改变考夫曼。因为他从来就没有读过任何医学预科的课程，所以他就安排自己于<span
  lang=EN-US>1963</span>年秋季去柏克莱大学读一年的医学预科，然后再进入海湾另一端旧金山市的加利福尼亚大学医学院。于是，就是在柏克莱，他修了最初的发育生物学课程。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>他被这门课程强烈地震撼了。“这里有绝对令人震惊的现象。”他说。“从一个受精卵开始，然后这东西逐渐发育，变成了一个有秩序的新生命，然后又变成一个成熟的生命。”不知为什么，单个的受精卵能够分裂，变成不同的神经细胞，肌肉细胞和肝脏细胞，以及上百种不同的细胞，这个过程精确到万无一失。奇怪的不是生而缺憾的悲剧常有发生，而是大多数新生命一出生就完美无缺。“这至今仍然是生物学中最美丽的奥秘之一。”考夫曼说。“我整个儿地被细胞分化的问题给迷住了，马上就投入到对这个问题的深入思考。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>那时是做这项研究的一个大好时机：从<span
  lang=EN-US>1961</span>年一直到<span lang=EN-US>1963</span>年，雅各布（<span lang=EN-US>Jacob</span>）和莫纳德（<span
  lang=EN-US>Monod</span>）刚发表了他们关于遗传回路（<span lang=EN-US>genetic circuits</span>）的一系列论文。这项工作使他们后来获得了诺贝尔奖。（这正是阿瑟<span
  lang=EN-US>16</span>年以后躺在夏威夷海滩上读到的论著。）而考夫曼很快就读到了他们的观点。他们论述说，任何细胞都包含着几个“调节”基因（<span
  lang=EN-US>regulatory genes</span>），这些调节基因就像开关一样，能够打开或关闭其他基因。“他们的研究成为所有生物学家的启示录。如果基因能够相互打开和关闭，那么就会有遗传回路。在某种意义，基因组（<span
  lang=EN-US>genome</span>）就会是一种生化计算机。正是整个系统的这种计算机行为，即有秩序的行为，以某种方式决定了细胞之间的差别。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>但问题是，这些细胞差别是怎样形成的呢？<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>考夫曼说，其实，大多数研究人员曾经（在这点上，甚至到现在）都并不过于为这个问题操心。他们谈论着细胞的“发育程式”，仿佛<span
  lang=EN-US>DNA</span>计算机真的像<span lang=EN-US>IBM</span>主机执行用<span lang=EN-US>FORTRAN</span>语言编写的程序一样执行遗传指令：一步一步地逐条执行。更有甚者，他们好像相信这些遗传指令是精确无误的组织，就像任何人编写的计算矾代码一样被自然选择法完全排除了误差。怎么可能不是这样的呢？遗传程序中的最微小的错误都会导致一个发育中的细胞的癌变，或可以将之完全置于死地。这就是为什么成百的分子基因学家早就开始在实验室里努力译解精确无误的生化机制，研究在这个生化机制中基因<span
  lang=EN-US>A</span>是如何打开基因<span lang=EN-US>B</span>的，基因<span lang=EN-US>C</span>、<span
  lang=EN-US>D</span>、<span lang=EN-US>E</span>的活动又是如何影响整个开关过程的。他们认为，一切都在这些细节之中。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>但考夫曼越是思考这幅图景就越是发现，细胞差别是怎样形成的这个问题正赫然耸立于眼前。基因组就像计算机，很好，但它又完全不是<span
  lang=EN-US>IBM</span>公司生产的计算机。他发现，在一个真正的细胞里，许许多多的调节基因可以同时作用。所以，基因组电脑不像人类制造的计算机那样逐步执行指令，而是同步地、平行地执行大多数，或所有的遗传指令。他推理，如果情况真是这样的话，那么，重要的不在于是否这个调节基因精确地按照界定好的顺序激活了那个调节基因。而是这个基因组作为一个整体，是否能够安顿下来，将活性基因组合成一个稳定的、自我连贯的形态。调节基因最多也许能经历两个、三个或四个不同构型的循环，总之数目不多，否则细胞就会到处乱串，基因随机地相互开闭，陷于混乱状态。当然，肝脏细胞内活性基因的形态与肌肉细胞或脑细胞内的活性基因形态会非常不同。但考夫曼想，也许这正是重要之处。单个的基因组能够有许多稳定的行为形式这一事实，也许正是发育过程中能够产生许多不同细胞类型的致因。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>人们都心照不宣地假设，细节就是一切。考夫曼对此感到十分困惑。他知道，生物分子的细节显然是十分重要的。但如果基因组必须被组合和调整到尽善尽美才能发挥作用，那它怎么会从随机的试验和进化的错误中诞生呢？这就像老老实实地洗一整副牌，却拿到一手的黑桃一样：不是没有这个可能，但这种可能性不大。“这感觉就不对。”他说。“别指望上帝或自然选择法会做到这一步。如果我们只能用大量详尽的、自然选择过程中未必能发生的细节来解释生物的秩序，如果我们现在所见到的从一开始都经历过艰难的挣扎，那我们今天就不会存在于此了。只有足够的宇宙空间和时间上的机遇并不能产生这一切。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>事情肯定不止于此。他想。“不知为什么，我想证明秩序是最初就出现的，并不是后天置入和演化出来的。我有意识地要证明，在遗传调节系统中，秩序是天然而成的，带有不可避免的性质。秩序以某种方式自由地存在于事物之中，它是自动形成的。”他推测到，如果情况果真如此，那么，生命的这个自动而自组的特征就正好和自然选择法背道而驰。根据达尔文的描述，任何一种生物体的精确的遗传详况都是随机演变和自然选择的产物。但生命本身的自组，即秩序，却具有更深刻、更根本的含义。秩序纯粹地产生于网络结构，而不是产生于细节。事实上，秩序是造物主的头等奥秘。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>“我不知道我哪来的这股冲动。”他说。“为什么斯图尔特·考夫曼凑巧来到这个世界，而且对秩序问题发生了兴趣？这整个儿就是个绝妙的谜。一个人的头脑能够对这个问题感到新鲜好奇，能够提出这类的问题，这使我感到既奇怪又惊喜。只是我这一生都有这样的感觉：好像我从事过、热爱过的所有科学研究，都是为解开这一谜团所做的努力。”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>确实，对一个二十四岁的医科大学预科生来说，关于秩序的问题就像他身上的一直不消的痒处。他好奇地想，遗传秩序自由地存在究竟意味着什么？好吧，就让我们看一看在真正的细胞里发现的遗传回路吧。它们显然经过几百万年进化的精加工。但另一个问题是，它们真的有什么特别的吗？在无数可能的遗传回路中，他们是唯一能产生有秩序的稳定构型的遗传回路吗？如果是这样的话，那它们就是一把黑桃牌的类似物了。进化居然能幸运到产生它们，那就真是个奇迹了。或者，稳定的网络就像拿到一手黑桃、红桃、草花和方块混合牌一样通常吗？因为如果情况果真是这样的话，那进化偶然选择了有用的遗传回路，就是一件轻而易举的事了。真正的细胞中的网络就会是正好凑巧通过了自然选择的那个了。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>考夫曼认为，寻找到答案的唯一方法就是洗牌，拿出一组完全典型的遗传回路，看看它们究竟会不会产生出稳定的构型。“所以我立刻就想到，如果把几千个基因随机地连挂在一起会发生什么呢？它们会产生什么效果？”<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>现在他知道他该如何思考这个问题了。他在牛津学过神经回路，他知道，真正的基因当然会相当复杂，但至少雅各布和莫纳德已经告诉过我们了，调节基因基本上只是开关。而一个开关的本质就是来回于两种状态之间：激活的状态和熄灭的状态。考夫曼喜欢把它们想成是电灯泡（开或关），或想成是一个逻辑状态（真的或假的）。但他觉得不管把它们想成是什么意象，却正是这种开或关的行为形成了调节基因的本质。剩下的只是相互作用的基因网络的问题了。当时柏克莱大学的自由演说运动正在校园蓬勃兴起，考夫曼却把他的课余时间都消遣在奥克兰他的公寓的楼顶上。他坐在那上面入迷地画着连挂在一起的调节基因的网络图形，力图搞清楚它们是怎样相互打开和关闭的。<span
  lang=EN-US><o:p></o:p></span></span></p>
  <p class=MsoPlainText style='mso-margin-top-alt:auto;mso-margin-bottom-alt:
  auto;line-height:22.0pt;mso-line-height-rule:exactly'><span lang=EN-US
  style='font-size:12.0pt'><span style='mso-spacerun:yes'>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
  </span></span><span style='font-size:12.0pt'>考夫曼对研究基因网络确实十分入迷，甚至一直到他完成了在柏克莱的医学院预科课程，回到旧金山，开始了医学院全日制课程以后，他还沉迷在这里面。这并不是因为他已经对医学院感到厌倦了，恰好相反：他发现医学院课程的难度非常非常大。他的老师要求他死记硬背