📄 0600cluster.htm
字号:
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
root]# </font><font color="#FFFF00">chmod 644 /etc/skel/.rhosts</font></font></font></td>
</tr>
</table>
</ul>
这样就妥当的设定好了 RSH 棉！
<br>
<br>
<hr WIDTH="100%">
<li>
<a NAME="step_pgi"></a><font color="#000099"><font size=+1>安装 Fortran
90 的编译程式 PGI pgf90 ( PS. server version )</font></font></li>
<br>
<br>我由 PGI 的官方网站下载了最新的 PGI Server 套件，请特别留意的是，由于
PGI 有两种模式，一种是工作站(Workstation)一种则是伺服器(Server)模式，其中，工作站仅能提供单一主机来操作，无法进行
Cluster 的功能的！因此，<font color="#000066">请务必要下载 Server 的版本</font>，并且是支援
Linux 版本的喔！不要搞混了！ PGI Fortran Server version 的下载网址在这个地方∶<a href="http://www.pgroup.com/downloads.htm" target="_blank">http://www.pgroup.com/downloads.htm</a>，请自行下载吧！比较需要留意的是，从上面这个网站下载的版本仅是分享软体的版本，您安装之后可以具有
15 天的免费使用期限，超过期限之后，又需要重新安装一次，很是麻烦的啦！如果您的
Cluster 是用来进行学术研究的，那么在测试完成之后，可能需要去他的网站注册，这个注册的费用差异可就很大了～因为未来我的
Cluster 需要一直不断的运作，因此是需要去注册的啦！并且，我只会用到 Fortran
这个编译器，因此，我就直接使用 PGIHPF 这个版本来测试安装而已，而不是使用全部
( 含 PGI Fortran 与 C ) 的版本喔！因为注册的价差差了两～三万台币啊！安装
Fortran 真是很简单的啦！假设您将 linux86-HPF.tar.gz 放置在 /root/software
底下，则∶(注∶以下的动作仅只要在 Master 上面进行即可喔！)
<br>
<table BORDER COLS=1 WIDTH="600" >
<tr>
<td BGCOLOR="#000000"><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>1.
建立 pgi fortran 在 /cluster/server/program/pgi 底下∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
root]# </font><font color="#FFFF00">cd /usr/local/src</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
src]# </font><font color="#FFFF00">mkdir pgi-fortran; cd pgi-fortran</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
pgi-fortran]# </font><font color="#FFFF00">tar -zxvf /root/software/linux86-HPF.tar.gz</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
pgi-fortran]# </font><font color="#FFFF00">./install</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1>接下来会有一些问题，请依序回答您的问题喔！</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1>至于授权嘛！请建立吧！</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1>最重要的地方，是在第三个问题，他会问你要安装的目录，请选择</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>/cluster/server/program/pgi</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1> </font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>2. 修改个人参数∶由于
RSH 不以 root 工作，所以我以使用者 test 来测试∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @serer
root]# </font><font color="#FFFF00">vi /home/test/.bashrc</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 加入这几行关于
PGI 的咚咚∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>PGI=/cluster/server/program/pgi</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>export PGI</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>PATH=$PGI/linux86/bin:$PATH</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1> </font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>3. 设定查寻路径∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
root]#</font><font color="#FFFF00"> vi /etc/man.config</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 加入这一行∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>MANPATH /cluster/server/program/pgi/man</font></font></font></td>
</tr>
</table>
<br>这样就好了吗？！没错！确实是这样就完成了！很是简单吧！ ^_^要注意的是∶
<br>
<ul>
<li>
记得 pgf90 必须要让所有的 node 都能够读的到，所以一定要安装在 Server 的分享出去的目录当中，我这里的例子就是安装在
/cluster/server/program/gpi 这个目录当中棉！</li>
<li>
执行档要能够执行，当然是必须要让目录在 PATH 这个变数底下，而我的 pgf90
是在 /cluster/server/program/pgi/linux86/bin 底下，所以，您的 PATH 必须要含有这个目录才行！</li>
</ul>
<br>大概就是如此棉！
<br>
<br>
<hr WIDTH="100%">
<li>
<a NAME="step_mpich"></a><font color="#000099"><font size=+1>安装 MPICH</font></font></li>
<br>
<br>前面我们提过了，安装 MPICH 是平行运算里面最重要的一项工作了！因为我们就是靠他来帮我们达成运作的啊！那么怎么来安装呢？又是简单得不得了啊！首先，请先下载
mpich 吧！下载的网址在底下，我是以 mpich 1.2.5-1a 来测试的喔！
<br>
<ul><a href="http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/download.html" target="_blank">http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/download.html</a></ul>
<br>假设您将 mpich 下载在 /root/software 里面，并且预计要安装到 /cluster/server/program/mpich
当中，而且仅安装 Fortran 而已的话，可以这样做∶
<br>
<table BORDER COLS=1 WIDTH="600" >
<tr>
<td BGCOLOR="#000000"><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>1.
建立 mpich 在 /cluster/server/program/mpich 底下∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
root]# </font><font color="#FFFF00">cd /usr/local/src</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
src]# </font><font color="#FFFF00">tar -zxvf /root/software/mpich.tar.gz</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
src]# </font><font color="#FFFF00">cd mpich-1.2.5</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
mpich-1.2.5]# </font><font color="#FFFF00">./configure --enable-debug \</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">></font><font color="#FFFF00">
-fc=pgf77 -f90=pgf90 \</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">></font><font color="#FFFF00">
--prefix=/cluster/server/program/mpich</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
mpich-1.2.5]#</font><font color="#FFFF00"> make && make install</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1> </font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>2. 建立可以利用的主机状态∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
mpich-1.2.5]# </font><font color="#FFFF00">cd /cluster/server/program/mpich/share</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
share]# </font><font color="#FFFF00">vi machines.LINUX</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>node1.cluster:2</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>node2.cluster:2</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>node4.cluster:2</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>server.cluster:2</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 这个档案当中，格式为
<主机名称>:<主机的 CPU 个数></font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1> </font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>3. 建立需要的变数∶(又是以
test 为准喔！)</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
root]# </font><font color="#FFFF00">vi /home/test/.bashrc</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 加入这一些资料∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>PATH=$PATH:/cluster/server/program/mpich/bin</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>export PATH</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>MPI_HOME=/cluster/server/program/mpich</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>MPI_ARCH=$MPI_HOME/bin/tarch</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>export MPI_ARCH
MPI_HOME</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
root]#</font><font color="#FFFF00"> vi /etc/man.config</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 加入这一行∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>MANPATH /cluster/server/program/mpich/man</font></font></font></td>
</tr>
</table>
<br>呵呵！这样就已经完成了 MPICH 的安装与设定了！就跟你说很简单吧！但是呢，要测试可就得需要特别留意了，因为
root 预设是不许使用 RSH 的，所以测试一定要使用一般身份的使用者，这里我以
test 这个人做为测试的使用者喔！所以，请以 test 的身份登入主机，并且，这个
test 必须要在所有的主机上面都可以被查询的到才行(请参考 NIS 的设定喔！)。
<br>
<table BORDER COLS=1 WIDTH="600" >
<tr>
<td BGCOLOR="#000000"><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[test
@server test]$ </font><font color="#FFFF00">cp -r /cluster/server/program/mpich/examples/
.</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[test @server
test]$</font><font color="#FFFF00"> cd examples</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[test @server
examples]$ </font><font color="#FFFF00">make pi3f90</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[test @server
examples]$ </font><font color="#FFFF00">mpirun -np 8 pi3f90</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 上面那个
-np 后面接的就是使用 CPU 的个数啦！因为我有 8 个 node ，</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 所以当然就以最大的
CPU 个数来测试看看，如果要看到底 CPU 有没有启动的话，</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 可以先登入各个
slave 的主机，然后执行『 top -d 1 』来观察 CPU 的使用率，</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FF6666"><font size=-1># 再执行上面这个程式，就能够知道
CPU 有没有运作了！ ^_^</font></font></font></td>
</tr>
</table>
<br>呵呵！没想到 PGI 的试用版本就能够提供多颗 CPU 的 Cluster 运作，真是给他很高兴！这样既然可以测试成功了，自然就可以去向
PGI 的官方网站注册了！注册费用不低，但是挺值得的啊！</ul>
<hr WIDTH="100%"><a NAME="othersetings"></a><font color="#000099"><font size=+1>其他主机相关设定∶</font></font>
<ul>除了一些基本的 Cluster 设定之外，您的主机其实可能还需要其他的设定项目的！最常见的可能就是
X-Window System 的 server/slave 架构了！您总不希望老是呆在 cluster 前面吧？！粉吵的呢！这个时候，或许就会希望可以在
Client 端连接上 Server 的 X Server 棉！
<br>
<br>
<hr WIDTH="100%">
<li>
<a NAME="othersetings_xwindow"></a><font color="#000099"><font size=+1>X-Window
Server/Slave 架构</font></font></li>
<br>
<br>架设一个很简单的 X Server 真的是很容易，容易到让你会很想笑出来～在上面的环境设定好了之后，请注意∶『<font color="#000066">您的主机应该是在
run-level 为三的文字模式底下，也就是没有 X Window 存在』</font>才对！这个时候，要设定完成
X Server ，仅要修改一个档案，并且启动一支程式即可！先说明一下我的环境∶
<br>
<br>X Server 主机的 IP 是 192.168.10.30，作业系统是 Red Hat 9；
<br>X Client 的 IP 是 192.168.10.100 ，作业系统同时是 Linux 与 Windows
2000 。
<br>
<ul>
<li>
<b><font color="#000099">X Server 的设定∶</font></b></li>
<br>由于我们需要启动监听来自 X Client 的要求，这个时候需要重新做一下设定∶
<table BORDER COLS=1 WIDTH="550" BGCOLOR="#000000" >
<tr>
<td><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>1. 先备份原先的设定档∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
root]# </font><font color="#FFFF00">cd /etc/X11/gdm</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
gdm]#</font><font color="#FFFF00"> mv gdm.conf gdm.conf.bak</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1> </font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>2. 编辑设定档，只要底下两行即可！</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
gdm]#</font><font color="#FFFF00"> vi gdm.conf</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>[xdmcp]</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFF00"><font size=-1>Enable=1</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1> </font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>3. 启动 gdm
∶</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
gdm]# </font><font color="#FFFF00">gdm</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @server
gdm]# </font><font color="#FFFF00">netstat -uln</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1>udp
0 0 0.0.0.0:177
0.0.0.0:*</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font color="#FFFFFF"><font size=-1># 如果有出现上面这行就对了！</font></font></font>
<br><font face="细明体"><font size=-1><font color="#FFFFFF">[root @⌨️ 快捷键说明
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