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MS-Clustering is designed to rapidly cluster large MS/MS datasets. The program merges similar spectr

YET	3	305
YNN	3	305
SLC	3	305
MGV	3	305
TQY	3	304
DHA	3	304
PYS	3	304
YNS	3	304
NQF	3	304
EMG	3	304
VTY	3	304
PPH	3	303
MVD	3	303
QDY	3	303
PNQ	3	302
SQY	3	302
NFT	3	302
YQD	3	302
AHT	3	302
QNG	3	302
YQV	3	301
SYT	3	301
EDH	3	301
GKE	3	301
MAT	3	301
TYS	3	301
HAP	3	301
LKN	3	300
MAD	3	300
NYS	3	300
VHD	3	300
TAH	3	300
TEY	3	300
AWL	3	300
VGH	3	300
NRP	3	299
EHT	3	299
YSQ	3	299
KAD	3	299
TGH	3	298
VHV	3	298
TSY	3	297
DLC	3	297
TYD	3	297
VYN	3	297
VNH	3	297
YVT	3	297
SDH	3	297
YPT	3	296
HTT	3	296
YGF	3	296
FPN	3	296
YNE	3	296
QSF	3	296
DME	3	295
PNF	3	295
MSE	3	295
AHS	3	295
RDL	3	295
FQS	3	295
GQY	3	294
YFD	3	294
FQN	3	294
PFF	3	294
GEK	3	294
LKT	3	294
EHD	3	294
NFN	3	293
LCS	3	293
SAM	3	293
GGR	3	293
QWL	3	293
DGH	3	293
QFT	3	292
EFQ	3	292
YDQ	3	292
DKF	3	292
GPY	3	291
YEQ	3	291
DDM	3	291
SYN	3	291
MPS	3	291
HPP	3	290
EGM	3	290
CGL	3	290
GFF	3	290
DFQ	3	290
SGM	3	289
KGD	3	289
DYF	3	289
LSC	3	289
DYN	3	289
EQM	3	289
VHS	3	289
KLN	3	288
EAK	3	288
SFQ	3	288
TQF	3	288
MQL	3	288
PQF	3	288
SWL	3	288
THV	3	288
FLY	3	288
QFN	3	287
TQN	3	287
VMA	3	287
LYF	3	287
DVM	3	287
AFQ	3	287
HET	3	287
EHN	3	287
MEA	3	286
NEY	3	286
HDS	3	286
VGM	3	286
GVM	3	286
FSH	3	285
TEH	3	285
HAT	3	285
CPL	3	284
NYQ	3	284
MAQ	3	284
GPF	3	284
LEC	3	284
TFP	3	284
HFD	3	284
DMT	3	284
GYQ	3	284
YQS	3	283
FFN	3	283
AYN	3	283
SSM	3	283
PQY	3	283
NYN	3	282
FPQ	3	282
NAY	3	282
MGS	3	282
QFS	3	282
VMV	3	282
MDD	3	281
KEV	3	281
AYQ	3	281
PWL	3	281
AMT	3	281
MPG	3	281
CLE	3	281
QFP	3	280
YNA	3	280
KEG	3	280
PYD	3	280
FQQ	3	280
EYP	3	280
PNY	3	280
KAL	3	280
MAG	3	280
TAY	3	279
VKD	3	279
EHF	3	279
YDN	3	279
PMA	3	278
CSL	3	278
FHP	3	278
QYA	3	278
PVM	3	278
QHG	3	278
SVH	3	278
GAH	3	278
HPN	3	278
TPY	3	278
THS	3	278
EYN	2	277
MPV	2	277
KDP	2	277
HTG	2	277
AHD	2	277
MVA	2	277
NPY	2	276
AKL	2	276
HTD	2	276
HTE	2	276
VFQ	2	276
ARP	2	276
GKV	2	275
HVP	2	275
YND	2	274
SPH	2	274
VVM	2	274
LKV	2	274
GFY	2	273
HVN	2	273
LSW	2	273
GHD	2	273
CEL	2	273
SYP	2	273
DAH	2	273
ETH	2	273
SNH	2	273
TAM	2	273
KAA	2	272
GYY	2	272
HDD	2	271
SHQ	2	271
VHQ	2	271
TGM	2	271
SHF	2	271
RPT	2	270
FDH	2	270
MEG	2	270
KPY	2	270
FFT	2	270
GMT	2	270
FSF	2	270
HVG	2	269
LER	2	269
HNA	2	269
QHA	2	269
ANK	2	269
NKD	2	268
LCA	2	268
TVY	2	268
VLC	2	268
EMD	2	268
LGC	2	268
YFG	2	268
ESM	2	267
FDY	2	267
NYA	2	267
ETM	2	267
WLS	2	267
MES	2	266
YKP	2	266
QQH	2	266
LCN	2	266
QYP	2	266
VQF	2	265
SMG	2	265
HTS	2	265
MTD	2	264
TNY	2	264
DKY	2	264
NVY	2	264
STH	2	263
ENH	2	263
PLW	2	263
TNF	2	263
QHP	2	263
MDS	2	263
GLW	2	262
MGD	2	262
YPN	2	262
GHF	2	262
PDK	2	262
PYF	2	262
YEP	2	262
EYF	2	262
QHQ	2	262
QTF	2	262
YQP	2	261
TYV	2	261
AFF	2	261
SME	2	260
SQH	2	260
MEQ	2	260
PMD	2	260
HNP	2	260
LWQ	2	260
THE	2	260
DRL	2	260
DVH	2	259
VPH	2	259
QGY	2	259
KDF	2	259
SHN	2	259
FQA	2	258
QHV	2	258
PFN	2	258
YDF	2	258
ELW	2	258
GFQ	2	258
YNT	2	257
PVK	2	257
DPP	2	257
PRP	2	257
TDM	2	256
AKD	2	256
MDV	2	256
MSA	2	256
QYQ	2	255
MPE	2	255
VYQ	2	255
EHQ	2	255
DHF	2	255
VHN	2	255
TYT	2	255
CLS	2	254
HQQ	2	254
KVP	2	254
TMG	2	254
RPQ	2	254
GQH	2	254
DGM	2	254
LCP	2	254
VVK	2	254
KVT	2	254
SYF	2	254
WLT	2	254
PHA	2	254
QNF	2	253
MDG	2	253
LVC	2	253
NNY	2	253
NYP	2	253
QAY	2	253
RDE	2	253
GHN	2	253
MTA	2	252
TVH	2	252
HQE	2	252
YQT	2	252
DHT	2	252
AKE	2	252
GME	2	252
ASM	2	251
QYE	2	251
ENK	2	251
FYD	2	251
QPF	2	251
GDM	2	251
QEM	2	250
MTE	2	250
FEH	2	250
HFG	2	249
HNE	2	249
MAV	2	249
RLP	2	249
NYV	2	249
QQY	2	249
HFV	2	249
LWS	2	248
AHQ	2	248
DMG	2	248
CTL	2	248
VYT	2	248
SGK	2	248
REL	2	248
VHT	2	247
DKN	2	247
YGN	2	247
VMT	2	247
YYD	2	247
MPA	2	247
GMS	2	246
QHE	2	246
ATM	2	246
VNK	2	246
HFE	2	246
AMS	2	245
YFP	2	245
CLP	2	245
FQT	2	244
HYG	2	244
DKT	2	244
VMP	2	244
GCL	2	244
HDP	2	244
YTN	2	244
HES	2	244
TEM	2	244
YYG	2	243
AHN	2	243
YGY	2	243
QMA	2	243
AMP	2	243
THA	2	243
NTY	2	243
LCT	2	242
HST	2	242
QEH	2	241
PYP	2	241
MVV	2	241
DLR	2	241
WLN	2	241
TCL	2	241
NKV	2	241
ANM	2	241
DLW	2	241
PYT	2	241
SVM	2	241
EMP	2	240
DTH	2	240
GKT	2	240
REE	2	240
ASK	2	240
HEQ	2	240
DSM	2	240
ENM	2	240
NQY	2	240
APH	2	240
VDM	2	240
YFS	2	239
MTG	2	239
FEF	2	239
SYY	2	238
PPN	2	238
DMP	2	238
FVH	2	238
MET	2	237
KEP	2	237
QYD	2	237
GLC	2	237
TDH	2	237
LAC	2	237
MSD	2	237
FRP	2	237
TYP	2	237
WDD	2	237
KLS	2	236
LAW	2	236
YNV	2	236
FYT	2	235
PAM	2	235
YAQ	2	235
QGH	2	235
HNG	2	235
QVY	2	235
NPH	2	235
PEK	2	235
TYN	2	234
NYE	2	234
QPN	2	234
FLK	2	234
TTY	2	234
FFP	2	234
DMS	2	234
HGF	2	234
LEW	2	234
FQD	2	234
TYA	2	234
KLG	2	233
QSY	2	233
KEQ	2	233
DNY	2	233
RGG	2	232
CLV	2	232
DHQ	2	232
ANH	2	232
FNF	2	232
EKA	2	232
VPM	2	232
QYS	2	231
GHQ	2	231
LTC	2	231
EKV	2	231
TRP	2	231
TTH	2	230
GFH	2	230
VMS	2	230
NHS	2	230
THD	2	230
SYQ	2	230
MSG	2	230
VFH	2	230
GVK	2	230
MEN	2	230
FYS	2	230
YQN	2	229
FYG	2	229
GYF	2	229
AFY	2	229
AQM	2	229
HSN	2	229
YFE	2	229
LCQ	2	229
LGR	2	228
CLD	2	228
KTL	2	228
NHV	2	228
APM	2	228
DKQ	2	228
MDP	2	227
WTL	2	227
YPQ	2	227
QTY	2	227
PAK	2	227
PDM	2	227
MQE	2	227
PPF	2	227
WDE	2	227
CAL	2	227
LGW	2	226
SEK	2	226
LKS	2	226
NFF	2	226
EEC	2	226
YVQ	2	225
YTV	2	225
HEF	2	225
AYF	2	225
FAH	2	225
NWL	2	225
FFA	2	224
NMV	2	224
TMA	2	224
EYY	2	224
CVL	2	224
MGE	2	224
HGP	2	223
MTP	2	223
GRG	2	223
PFY	2	223
YNG	2	223
QAM	2	222
AMN	2	222
FYA	2	222
FYP	2	222
FVF	2	221
LPW	2	221
NYT	2	221
EHY	2	221
MGT	2	221
MEV	2	221
EMF	2	221
EMQ	2	220
AWA	2	220
HPQ	2	220
KQL	2	220
HLM	2	220
EMT	2	220
PFQ	2	220
MAP	2	220
SLW	2	220
FEY	2	219
AMQ	2	219
THF	2	219
THQ	2	219
QSH	2	219
SDM	2	219
LPK	2	218
GMP	2	218
DNM	2	218
DYY	2	218
NLC	2	218
TWL	2	217
HEN	2	217
FTF	2	217
YFA	2	217
PLC	2	217
GGK	2	217
QRP	2	217
LWE	2	216
MVT	2	216
NHA	2	216
GTM	2	216
EPY	2	216
KQE	2	216
TYQ	2	216
MKP	2	215
RLD	2	215
PHS	2	215
KDT	2	215
MAN	2	215
FPP	2	214
GSM	2	214
NYF	2	214
PMV	2	214
VGK	2	214
GMN	2	214
KTE	2	214
YYS	2	214
VSK	2	214
VHF	2	213
WLV	2	213
VSM	2	213
DPH	2	213
CLA	2	213
YTT	2	212
KVV	2	212
SKD	2	212
LWA	2	212
STM	2	212
NAH	2	212
YNQ	2	212
AHF	2	211
VQH	2	211
LNC	2	211
KNL	2	210
MSS	2	210
FQV	2	210
NDM	2	210
HQD	2	210
HQP	2	210
MQQ	2	210
DVK	2	210
TLC	2	210
PPY	2	210
GPM	2	210
GWL	2	210
HHP	2	209
PTM	2	209
AYY	2	209
HSQ	2	209
KFE	2	209
KDN	2	209
MVS	2	209
TFF	2	209
TME	2	208
HFA	2	208
EMS	2	208
NKE	2	208
NSH	2	208
GLR	2	208
PGK	2	208
SSC	2	208
VCP	2	207
QFF	2	207
HFT	2	207
PQH	2	207
DRD	2	207
TQH	2	207
HPF	2	206
HQT	2	206
MQA	2	205
WLG	2	205
TLR	2	205
KDS	2	205
ACL	2	205
FYE	2	204
QMV	2	204
MDN	2	204
ALW	2	204
PHE	2	204
HKP	2	204
SMV	2	204
LRL	2	204
NEH	2	203
WGL	2	203
PHT	2	203
NYY	2	203
PDW	2	203
CLG	2	203
YTQ	2	202
SCS	2	202
DMD	2	202
THN	2	202
GQM	2	202
FTH	2	202
YDK	2	202
WEL	2	202
PYQ	2	201
HFS	2	201
CSS	2	201
QDK	2	201
QAH	2	201
FHG	2	201
DNK	2	201
QFQ	2	201
VKG	2	201
SDW	2	200
QCL	2	200
FGH	2	200
QNY	2	200
KPH	2	200
FNH	2	200
PLR	2	200
EFK	2	200
MDT	2	200
SFY	2	200
PYY	2	199
WAL	2	199
DWD	2	199
LWN	2	199
KEN	2	199
DWE	2	199
QQM	2	198
FLM	2	198
CPE	2	198
GHY	2	198
QTH	2	198
SMD	2	197
KVA	2	197
PSM	2	197
MVQ	2	197
SPM	2	197
GNH	2	197
SNK	2	197
YHP	2	197
PMG	2	197
EPM	2	197
PHD	2	196
SLR	2	196
SHY	2	196
MQD	2	196
NAM	2	196
HGN	2	196
HAQ	2	196
LFK	2	196
NVH	2	195
MTS	2	195
SMS	2	194
MVP	2	194
AKA	2	194
TSM	2	194
WQL	2	194
CNL	2	194
WLP	2	194
PYN	2	194
PMP	2	194
NMG	2	194
MPT	2	194
VMN	1	193
TVM	1	193
KLF	1	193
EEW	1	193
TLW	1	193
CPA	1	193
CPS	1	193
NHE	1	193
TMD	1	193
VFY	1	193
FYQ	1	193
QDH	1	193
CGS	1	192
KAP	1	192
TEK	1	191
LQW	1	191
MGP	1	191
YHG	1	191
NGH	1	191
MVN	1	191
GKG	1	191
NHG	1	191
MNA	1	190
GSR	1	190
PPK	1	190
DAK	1	190
SKE	1	190
YLK	1	190
YSF	1	190
QYT	1	190
EAW	1	190
PMS	1	190
QYF	1	190
GCG	1	190
SKL	1	189
TAK	1	189
MFG	1	189
WSL	1	189
HDF	1	189
NHD	1	189
HHV	1	189
LYK	1	189
TMP	1	189
WEE	1	189
HTQ	1	189
CEE	1	188
MND	1	188
VAK	1	188
NHF	1	188
GEW	1	188
DTM	1	188
HPY	1	187
LVR	1	187
QLW	1	187
AAC	1	187
QHS	1	187
NGK	1	187
NMP	1	187
VLW	1	187
HSF	1	187
CLT	1	186
TMS	1	186
VKV	1	186
MLH	1	186
PME	1	186
HQS	1	186
AFH	1	186
YSY	1	185
TNH	1	185
VFF	1	185
VLR	1	185
KDY	1	185
YPP	1	185
DNH	1	184
MTV	1	184
HGQ	1	184
MNE	1	184
KNE	1	183
GDR	1	183
HDN	1	183
YFN	1	183
ATK	1	183
SMP	1	183
MDQ	1	183
EDW	1	183
QDM	1	182
NNH	1	182
EPH	1	182
VWD	1	182
FYN	1	182
QGM	1	182
YGH	1	182
PSK	1	182
TQM	1	181
QHF	1	181
AWV	1	181
FPF	1	181
FFV	1	181
HYA	1	181
CLN	1	181
GSC	1	180
DHY	1	180
PHF	1	180
MSV	1	180
SCP	1	180
RGE	1	180
CGG	1	179
FHQ	1	179
YYP	1	179
HDT	1	179
EMN	1	179
VTM	1	179
ASC	1	179
LWG	1	179
HAN	1	178
KET	1	178
KFD	1	178
KQD	1	177
NTH	1	177
VYF	1	177
VHH	1	177
TMV	1	177
VQY	1	177
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