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MS-Clustering is designed to rapidly cluster large MS/MS datasets. The program merges similar spectr

FVL	7	679
VTQ	7	679
SDN	7	679
HQL	7	678
PDP	7	678
LMA	7	677
LNY	7	677
VHL	7	677
GNA	7	676
TLH	7	676
FVD	7	676
NEN	7	676
DSF	7	676
GQS	7	675
PSN	7	675
EEY	7	675
NKP	7	674
QDA	7	674
PTD	7	674
HSL	7	673
GNS	7	673
LVF	7	673
ESQ	7	672
PDD	7	672
GQG	7	672
ETD	7	672
NSA	7	672
TYL	7	672
ATN	7	671
PDT	7	670
PPT	7	669
AGF	7	669
AML	7	669
FDS	7	668
APD	7	667
VQE	7	667
TDT	7	666
PQA	7	666
TEN	7	666
GFD	7	665
DVN	7	662
SNT	7	662
NDA	7	662
TPP	7	662
SQD	7	662
VPD	7	661
NSP	7	661
EQS	7	660
QGV	7	660
EQT	7	660
ALM	7	659
VNS	7	659
LHQ	7	659
LPY	7	659
FAG	7	658
GPD	7	657
FAD	7	657
LAM	7	656
FSS	7	656
ANT	7	656
PAQ	7	656
FGD	7	656
HNL	7	655
EDQ	7	655
VDN	7	654
PEF	7	654
QEQ	7	653
DQA	7	652
SAQ	7	651
PAF	7	650
LYT	7	650
QPS	7	650
GNT	7	649
DTT	7	649
FSP	7	648
PQE	7	648
AVQ	7	648
GGH	7	648
DTD	7	647
EVN	7	647
DFE	7	647
NAD	7	647
NPV	7	647
VGP	7	645
QQV	7	645
VTN	7	645
VGN	7	645
EFD	7	644
LFQ	7	643
SFS	7	642
NST	7	641
AFA	7	640
GDN	7	640
GDP	7	640
FSG	7	640
LQH	7	640
TEP	7	639
DNS	7	639
PVN	7	637
TAQ	7	637
DND	7	637
TGP	7	636
AFG	7	635
GEQ	7	635
VGQ	7	634
PAN	7	633
NVS	7	633
DFV	7	633
DGN	7	633
NTS	7	633
PQP	7	632
LEM	7	632
QAD	7	632
QES	7	632
LHV	7	631
EFE	7	631
GAQ	7	630
DNN	7	630
DLK	7	630
KLD	7	629
NDV	7	629
PVQ	7	629
EGN	7	628
SGQ	7	628
VNT	7	627
LTF	7	627
DSQ	7	626
HPE	7	626
QDV	7	625
SND	7	625
GNG	7	625
QAT	7	623
DQV	7	623
DTG	7	623
SLH	7	621
KPP	7	621
TQE	7	620
EGF	7	620
FES	7	620
QET	7	620
GSF	7	618
GQE	7	617
ADN	7	617
VLY	7	617
NTN	7	617
KLL	7	616
HGG	7	616
NDS	7	616
PHL	7	615
NSV	7	614
YTL	7	613
LVY	7	613
NTV	7	613
GND	7	613
SFD	7	613
TSQ	7	613
QVT	7	613
DDT	7	612
YQL	7	611
AND	7	611
EQF	7	610
VDF	7	610
GQP	7	610
ENT	6	609
EPP	6	608
ADQ	6	608
TNS	6	608
QGA	6	608
VNP	6	608
AQT	6	606
VFL	6	606
NES	6	606
LMG	6	605
ESN	6	605
SVN	6	605
PKP	6	605
FGE	6	605
ANN	6	605
NAT	6	604
AFE	6	604
PGQ	6	604
TQV	6	604
GLK	6	604
PTQ	6	602
SSY	6	602
VFG	6	601
TLY	6	601
YLQ	6	600
QPG	6	600
LPH	6	600
LGM	6	600
QPV	6	599
FAE	6	599
SFG	6	599
LMD	6	599
LME	6	599
GDF	6	598
NTP	6	598
TAN	6	598
DNG	6	598
AEH	6	598
SPQ	6	598
PEY	6	597
YNL	6	597
ENN	6	597
APQ	6	596
NGA	6	596
GNE	6	596
QGG	6	595
NLY	6	594
PQS	6	592
QGS	6	592
PNS	6	592
FGA	6	592
NTG	6	592
QLY	6	591
TNE	6	591
LNK	6	591
AAY	6	589
FET	6	589
NGD	6	589
GDK	6	589
GFE	6	588
AFD	6	588
AKP	6	588
SDF	6	588
VFS	6	588
DVQ	6	587
VDQ	6	587
QPE	6	587
GFV	6	584
PDF	6	584
DLM	6	583
EFA	6	583
VQS	6	583
YVL	6	583
EEM	6	582
TQT	6	582
GEF	6	581
DNP	6	581
FPE	6	580
QQP	6	579
EFV	6	578
NNV	6	577
VQG	6	577
AAM	6	577
FSD	6	577
TGQ	6	576
PNP	6	575
VVQ	6	575
GDQ	6	575
VNN	6	574
QPA	6	574
GQT	6	574
QTV	6	574
LDM	6	573
GTN	6	573
FVE	6	572
EDN	6	572
FSA	6	572
QQS	6	572
NNA	6	572
LTY	6	571
STQ	6	571
SLK	6	570
FDV	6	570
DFT	6	570
NVP	6	570
NNE	6	569
MAL	6	568
GPT	6	568
EVF	6	566
SQQ	6	566
MDL	6	566
QSP	6	565
DNT	6	565
SEF	6	564
TNV	6	564
FEG	6	564
VEF	6	563
QPQ	6	563
EAY	6	563
DGF	6	562
RPE	6	562
DKV	6	561
NET	6	560
QPP	6	560
MLG	6	560
FVA	6	560
NPN	6	559
DYV	6	559
LKL	6	559
QEG	6	558
EDY	6	558
KDE	6	558
PSF	6	557
HPD	6	557
FGP	6	556
NAP	6	556
PVF	6	556
SFE	6	556
GML	6	555
QDG	6	555
HLN	6	555
QTA	6	555
QED	6	555
TNN	6	555
HLQ	6	555
EFG	6	554
TGN	6	553
QDE	6	553
TNG	6	553
AQD	6	553
DKE	6	553
NNT	6	553
ASF	6	551
EPD	6	550
QSQ	6	549
MPL	6	549
NND	6	549
PGF	6	549
NQV	6	549
GHG	6	547
QDS	6	547
AQP	6	547
TVN	6	547
TQS	6	546
NDN	6	546
QAP	6	545
DFG	6	544
QTG	6	544
EGQ	6	543
DEY	6	543
QGD	6	543
PNA	6	542
PQQ	6	542
AMA	6	542
MLT	6	542
PQT	6	542
NGT	6	541
DKD	6	541
NVT	6	541
EDK	6	541
EKL	6	540
PPQ	6	539
FTS	6	539
NTE	6	539
YEE	6	539
LLC	6	539
DGQ	6	538
QVD	6	538
PNV	6	538
SML	6	538
SQT	6	537
DPQ	6	537
EQD	6	537
PLM	6	536
NPG	6	536
SLM	6	535
RPG	6	535
MEL	6	534
SDQ	6	534
NDP	6	533
DQE	6	533
FTP	6	533
GFA	6	533
YDA	6	532
NDG	6	532
FTG	6	532
DGP	6	530
VQD	6	530
PQG	6	530
ENQ	6	530
SAF	6	530
FDP	6	529
TPQ	6	528
LYV	6	528
QGQ	6	528
DYD	6	527
FNE	6	527
PLK	6	526
EGY	6	525
PDN	6	525
GFT	6	525
GLM	5	524
FSQ	5	524
DNE	5	523
FDG	5	522
QSE	5	522
MVL	5	521
NEQ	5	521
QDD	5	521
TQP	5	521
AAH	5	520
FTD	5	520
TTQ	5	519
VQQ	5	519
TQG	5	518
AFS	5	518
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NNP	5	517
ETQ	5	516
VQT	5	515
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KPF	5	515
SVQ	5	514
FAS	5	514
FTE	5	514
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VYL	5	508
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NEG	5	507
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TND	5	502
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EYG	5	495
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NEP	5	489
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QPT	5	488
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QTE	5	486
DQS	5	486
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FTA	5	484
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FVG	5	481
HPV	5	480
NVN	5	480
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PML	5	480
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DSY	5	479
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PGN	5	478
GFP	5	478
QST	5	478
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TGF	5	477
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EEH	5	477
HSG	5	477
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GVF	5	477
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FLH	5	476
FVP	5	476
PNG	5	475
NAN	5	475
GMG	5	474
GPN	5	474
AFN	5	473
FVT	5	473
NEF	5	473
SFV	5	473
FAP	5	473
SNQ	5	473
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ENF	5	472
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ANF	5	470
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KVE	5	469
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TPN	5	469
QQG	5	469
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GVQ	5	468
EYD	5	468
CLL	5	468
FSN	5	468
MGG	5	467
FAN	5	467
PFD	5	467
VDK	5	467
VQP	5	467
VPN	5	467
GYD	5	466
NDT	5	466
HGA	5	466
VVF	5	466
FDN	5	465
DQD	5	465
SVF	5	465
FNP	5	465
NDF	5	465
MLS	5	465
QAN	5	464
GNY	5	464
FGT	5	464
EFT	5	464
FGN	5	464
VSF	5	463
VPQ	5	463
FPV	5	463
QAF	5	463
GEY	5	463
YSP	5	463
NSF	5	463
STF	5	462
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LKA	5	462
DFN	5	461
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TFD	5	461
TEF	5	461
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PNE	5	460
SPF	5	459
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KPQ	5	457
SQF	5	457
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LGK	5	455
MLP	5	455
NNQ	5	455
EQP	5	454
QVP	5	454
FPD	5	454
EPQ	5	454
YED	5	453
FST	5	453
YSE	5	453
NFD	5	453
QLH	5	452
PND	5	452
GTF	5	452
SYS	5	450
VFV	5	449
QEN	5	448
YGP	5	448
GYS	5	447
YGA	5	446
YEG	5	446
FPA	5	446
VYD	5	446
DAY	5	446
HGS	5	446
QNA	5	446
GQQ	5	445
ETF	5	445
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AHG	5	444
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SFP	5	443
KLA	5	443
PPD	5	443
TSF	5	443
AYA	5	443
LPM	5	443
DPF	5	442
HLF	5	442
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TFS	5	442
HGV	5	441
SSH	5	441
VFA	5	441
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QTT	5	439
SGY	5	439
GHP	5	439
GSH	5	439
HEE	5	439
KDA	5	438
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VLK	5	438
VRP	5	438
LVM	5	438
QGP	5	438
GYA	5	437
SEY	4	436
HAA	4	436
FAT	4	436
QGT	4	436
NPP	4	436
FNS	4	436
NNG	4	435
ETN	4	435
QTQ	4	435
LRD	4	435
QSD	4	434
GYT	4	434
LAK	4	434
YGV	4	433
EMA	4	433
SAY	4	433
NSQ	4	433
FVN	4	433
DVY	4	433
DDK	4	433
EYE	4	432
TVQ	4	432
DNQ	4	432
HTV	4	431
EHA	4	431
DQG	4	431
TLM	4	431
DYE	4	430
FDQ	4	430
GVH	4	430
NML	4	430
YSD	4	429
FPS	4	428
EKE	4	428
PGH	4	428
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PFA	4	427
VLM	4	427
PFG	4	426
YSS	4	426
TFG	4	426
YDD	4	426
YEA	4	425
VHG	4	425
EQY	4	425
LKQ	4	425
QKP	4	425
DGK	4	425
VYS	4	425
EHG	4	424
AQY	4	424
VHP	4	423
YGD	4	423
SYD	4	422
TVF	4	421
DYA	4	421
TFA	4	421
TAF	4	421
VML	4	420
THP	4	420
SYE	4	419
DQT	4	419
SFN	4	419
GYV	4	419
YVE	4	419
QVQ	4	419
DFP	4	419
GYP	4	418
MLQ	4	418
AHP	4	418
HVA	4	418
YVD	4	418
FKP	4	417
DAM	4	417
QNP	4	416
YVP	4	416
GYE	4	416
FPT	4	416
AQN	4	416
QGF	4	416
ESY	4	415
PEH	4	415
LMT	4	415
VTF	4	415
SQN	4	414
YPE	4	414
DPG	4	413
GKL	4	413
AVH	4	412
FGF	4	411
EHV	4	411
ATF	4	410
LMV	4	410
QLK	4	410
PTF	4	410
LVK	4	409
FND	4	409
PFP	4	409
AME	4	409
DDQ	4	408
DNF	4	408
FQL	4	408
YAD	4	407
AFT	4	407
PSY	4	407
MEE	4	407
LMQ	4	407
FNA	4	406
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HSS	4	405
SNF	4	405
LDW	4	405
LFF	4	404
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SHV	4	404
SGH	4	403
PSH	4	403
YVA	4	403
AYE	4	403
YPG	4	403
EAH	4	403
DHP	4	402
YQA	4	402
NAQ	4	402
KEA	4	402
ERP	4	402
VFP	4	402
EME	4	402
TYG	4	402
GTY	4	402
LHY	4	401
ADH	4	401
SHS	4	401
NGP	4	401
KGE	4	400
GAY	4	400
PGY	4	399
SPY	4	398
LTK	4	398
GHA	4	398
DYG	4	398
EFP	4	397
YAG	4	397
NFG	4	396
ETY	4	396
FNT	4	395
YTG	4	395
LSK	4	395
ENY	4	395
NQP	4	394
QEF	4	394
YDP	4	392
VFT	4	392
GNF	4	392
MLN	4	392
QQD	4	392
FAV	4	392
AEM	4	391
PAY	4	391
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DQP	4	391
MDE	4	390
AQF	4	390
PFS	4	390
NPF	4	390
YAP	4	390
VAY	4	389
DTQ	4	388
VQN	4	388
TDQ	4	388
QTD	4	387
NTQ	4	386
YPD	4	386
YDV	4	386
HYL	4	386
NKL	4	386
HEV	4	386
FDF	4	385
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