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MS-Clustering is designed to rapidly cluster large MS/MS datasets. The program merges similar spectr

LLL	20	716
LLE	20	681
ALL	20	654
LLD	20	641
LGL	20	573
LLA	20	570
SLL	20	548
LLS	20	499
LAL	20	466
GLL	20	465
LAA	20	461
ALE	20	461
ELL	20	458
LLN	20	450
VLL	20	443
LLG	20	441
ALA	20	422
DLL	20	399
AAL	20	397
LAE	20	394
NLL	20	392
LLV	20	382
LAD	20	372
ALG	20	370
LVL	20	369
LLT	19	367
LSL	19	360
QLL	19	348
TLL	19	348
VLE	19	341
LLQ	19	336
LPL	19	327
SLS	19	323
LLP	19	323
ALD	19	319
LNL	19	316
VLA	19	314
LAS	19	312
LVE	19	310
LGE	19	304
LDL	19	303
LTL	19	301
AAA	19	300
VLG	19	299
ELE	19	298
VLD	19	295
SLE	19	294
SLA	19	289
LVS	19	289
ALS	19	288
DLA	19	286
EAL	19	285
VAL	19	283
LAG	19	282
SSS	19	282
TLA	19	281
LVD	19	281
LEE	19	279
ELA	19	278
ALV	19	277
VLV	18	272
SLD	18	270
LGG	18	266
LSE	18	262
LSS	18	262
LGA	18	262
AVL	18	255
AGL	18	254
LSD	18	253
LAQ	18	252
VLS	18	252
LEL	18	250
SAL	18	249
GGG	18	247
DLS	18	247
TLE	18	247
VVL	18	246
LSA	18	244
DLE	18	244
SLG	18	243
SLT	18	242
LGD	18	241
LVA	18	240
SSL	18	238
HLL	18	236
GLD	18	235
TLD	18	234
ALT	18	233
GLV	18	232
ASL	18	229
LGV	18	228
LDE	18	227
DAL	18	225
DGL	18	225
AAV	18	224
LAT	18	223
LTE	18	222
LSG	18	222
SLV	18	221
LPA	18	219
GLA	18	219
VLT	18	219
TAL	18	218
LTA	18	218
AAG	18	215
SGL	18	215
EEL	18	215
GLE	17	213
AAE	17	213
STL	17	213
TLS	17	212
ALN	17	211
SLP	17	211
LLH	17	210
TLT	17	209
LNE	17	209
AEL	17	209
LED	17	209
LVG	17	208
GLG	17	207
LQE	17	207
LPE	17	207
GLS	17	207
ELD	17	206
DLV	17	205
GLT	17	205
AVA	17	204
LAN	17	203
VLP	17	203
DVL	17	203
ADL	17	202
DLG	17	201
LAP	17	201
SGG	17	201
LEA	17	200
LVV	17	199
ELS	17	197
LSN	17	197
EEE	17	196
LGS	17	194
TLV	17	194
LQL	17	194
LDA	17	192
GVL	17	190
LVT	17	190
DLD	17	190
TVL	17	189
LDD	17	188
DLP	17	188
VTL	17	188
AQL	17	187
SPL	17	187
LSV	17	186
LAV	17	186
VLN	17	185
QLA	17	185
LPV	17	184
DLT	17	183
TPL	17	183
ALQ	17	183
VDL	17	183
ELV	17	183
VAA	16	181
LTD	16	181
EVL	16	181
QAL	16	180
VLQ	16	179
LQA	16	179
SEL	16	177
VGD	16	176
LSP	16	176
LEQ	16	175
SVL	16	175
EGL	16	175
ALP	16	174
LKP	16	174
SLN	16	174
ELG	16	173
LQQ	16	173
LSQ	16	172
LES	16	172
LFE	16	171
SLQ	16	171
AGA	16	171
LDS	16	170
DSL	16	170
KLE	16	170
ATL	16	169
LTS	16	169
LLF	16	169
NLD	16	169
GGL	16	169
LEG	16	168
GAL	16	167
VVD	16	167
SDL	16	167
LND	16	166
LPS	16	166
NLA	16	166
QLE	16	166
LFL	16	166
FLL	16	165
LVN	16	165
LPG	16	165
HLA	16	163
TSL	16	163
AAS	16	163
VVA	16	163
VAE	16	163
NAL	16	163
VNL	16	162
VAV	16	162
LKE	16	161
AVE	16	161
VGL	16	160
NVL	16	160
EAA	16	159
KLL	16	159
LHL	16	159
LYL	16	159
AGG	16	159
NLV	16	158
GLP	16	158
TLG	16	157
LST	16	157
AEA	16	157
GSL	16	157
LVQ	15	156
LEN	15	156
LTG	15	155
ESL	15	155
SGS	15	154
SQL	15	154
SAA	15	153
LTP	15	153
MLL	15	153
NGL	15	152
VEL	15	152
NLE	15	152
EQL	15	152
LFD	15	151
TLP	15	151
VSL	15	150
NLS	15	150
GEL	15	150
AGE	15	149
SSG	15	149
APL	15	149
TGL	15	148
TTT	15	148
AGD	15	148
GAA	15	148
SLF	15	148
ELP	15	148
GDL	15	147
FGL	15	147
VPL	15	146
NSL	15	145
GFG	15	145
ANL	15	145
LNV	15	144
AAT	15	144
LYE	15	144
LDG	15	143
YLL	15	143
LNA	15	143
FLD	15	142
FLS	15	142
NLN	15	142
EAE	15	142
TAA	15	142
SVA	15	141
TTL	15	141
DDL	15	141
AVV	15	140
ELF	15	140
TLQ	15	140
DLN	15	140
DTL	15	140
LPD	15	139
LVP	15	138
ELN	15	138
LQD	15	138
FLE	15	138
LDT	15	138
GTL	15	137
FLN	15	137
LGQ	15	137
QLG	15	137
LNS	15	137
LKD	15	137
AEE	15	136
DDD	15	136
LGP	15	136
STT	15	136
SGD	15	136
LTN	15	136
LTT	15	136
LDV	15	135
VVE	15	135
YLD	15	135
QLS	15	135
EDL	15	135
LET	15	135
LEV	15	135
LGT	14	134
ELT	14	134
LGY	14	134
KEE	14	134
AAD	14	133
SNL	14	133
HLE	14	133
VVV	14	133
TEL	14	132
TLN	14	132
LPT	14	132
LTQ	14	132
PLL	14	131
TQL	14	131
LFT	14	131
QQL	14	130
VAD	14	130
NLP	14	130
QVL	14	130
QSL	14	129
KPL	14	129
ELQ	14	128
YLG	14	128
SHL	14	128
SGA	14	127
LNQ	14	127
VSD	14	127
DSS	14	127
DAG	14	127
LTV	14	127
GGS	14	127
LNN	14	126
SSA	14	126
TDL	14	126
NNL	14	126
TVA	14	126
QLD	14	125
ASG	14	125
APV	14	125
LLY	14	125
SST	14	125
VEE	14	125
NLT	14	125
AQA	14	124
DEL	14	124
DQL	14	124
NLG	14	124
LRP	14	124
DVD	14	124
AAP	14	124
VGA	14	124
TVE	14	123
DGV	14	123
LGN	14	123
QQQ	14	123
ALF	14	123
LYD	14	123
LQS	14	122
SLY	14	122
VVG	14	122
AGV	14	122
AVT	14	121
ASS	14	121
SVE	14	121
AVS	14	121
VLF	14	120
DVA	14	120
YGL	14	120
LFS	14	120
YLA	14	120
YLS	14	120
SSD	14	120
DGS	14	119
SGE	14	119
GLF	14	119
STS	14	119
SAD	14	118
YLE	14	118
HLD	14	118
GPL	14	118
AFL	14	118
TPA	14	118
LFA	14	118
KVL	14	118
AGS	14	117
MLD	14	117
ASE	14	117
AAQ	14	117
ASA	13	116
SSP	13	116
MLA	13	116
VLH	13	116
DGE	13	116
SAS	13	116
VAS	13	116
ETL	13	116
ENL	13	116
VSS	13	116
SFL	13	116
LLK	13	116
ALH	13	115
LFG	13	115
HGL	13	115
DNL	13	115
SAG	13	115
VVS	13	115
EGE	13	115
SSV	13	115
MLE	13	114
EVA	13	114
LNT	13	113
SVS	13	113
NDL	13	113
SLH	13	112
SVD	13	112
DAA	13	112
SAV	13	111
GLN	13	111
FAL	13	111
LDQ	13	111
QLQ	13	111
DSG	13	111
VSA	13	110
VEA	13	110
LFN	13	110
EAV	13	109
ATA	13	109
VPV	13	109
LFV	13	109
KPE	13	109
LGF	13	109
NGE	13	108
DAE	13	108
KLA	13	107
NGG	13	107
QLT	13	107
LPQ	13	107
TSS	13	107
ALY	13	107
DGA	13	106
SVV	13	106
LPP	13	106
NGV	13	106
EVE	13	105
GGA	13	105
DVV	13	105
QGL	13	105
DLQ	13	104
SPS	13	104
VTD	13	104
ADV	13	104
DSE	13	104
QLV	13	104
LSF	13	104
LQT	13	104
DLF	13	103
STG	13	103
TNL	13	103
YLN	13	103
DGD	13	103
GFL	13	103
AVD	13	103
HLG	13	103
GSG	13	103
SAT	13	102
VQL	13	102
VVT	13	102
VGE	13	102
GAV	13	102
DAT	13	102
MLS	13	102
VPA	13	102
HLQ	13	102
VVN	13	102
VAG	13	102
GVA	13	101
EED	13	101
VTV	13	101
VSG	13	101
LDN	13	101
NYL	13	101
DFL	13	101
ATG	13	101
GSS	13	101
DGT	13	101
HLV	13	101
ASV	13	101
TST	13	101
DLK	13	101
NGS	13	101
SAP	12	100
TAE	12	100
LQV	12	100
LHE	12	100
FSL	12	100
DVE	12	100
LYS	12	100
LKL	12	100
NPL	12	100
TGE	12	99
DEE	12	99
HVL	12	99
APE	12	99
LSH	12	99
RLE	12	99
TPE	12	99
LAH	12	99
GNL	12	99
SSE	12	99
TSD	12	99
STA	12	99
TLF	12	99
LNP	12	99
GVS	12	98
VTS	12	98
DDE	12	98
VDE	12	98
FLA	12	98
GQV	12	98
LYG	12	98
VET	12	98
VSE	12	98
NLF	12	98
AEV	12	97
QLP	12	96
QEL	12	96
MNL	12	96
LDP	12	96
VPS	12	96
SFE	12	96
APA	12	96
HLT	12	96
THL	12	95
LYQ	12	95
EEA	12	95
LHS	12	95
NNN	12	95
SDS	12	95
HLS	12	95
LME	12	95
GGV	12	95
EAG	12	95
LKA	12	95
VHL	12	95
VAP	12	95
LNG	12	94
AKL	12	94
FLP	12	94
SGT	12	94
SPA	12	94
APG	12	94
DED	12	94
SAE	12	94
SPE	12	93
SYL	12	93
TEE	12	93
QTL	12	93
DAV	12	93
VTE	12	93
HNL	12	93
GYL	12	93
YLV	12	93
NEL	12	93
AVG	12	93
SGP	12	93
GAT	12	93
VTA	12	93
VSV	12	92
FVL	12	92
QDL	12	92
KLD	12	92
GSV	12	92
STP	12	92
LVF	12	92
APS	12	92
KGE	12	91
GEG	12	91
EEG	12	91
LQG	12	91
LDF	12	91
FLT	12	91
SPV	12	91
LGH	12	91
VDA	12	91
FAD	12	91
GLH	12	91
FLG	12	91
GLQ	12	91
TLH	12	90
GAD	12	90
VGV	12	90
AYL	12	90
ELY	12	90
AED	12	90
TGA	12	90
GVE	12	90
ASD	12	90
FGG	12	90
GAG	12	90
GQL	12	90
FDL	12	89
YAL	12	89
MGL	12	89
KGL	12	89
SVT	12	89
VAT	12	89
NTL	12	89
TEA	12	89
VGS	12	89
QLN	12	89
EFL	12	89
SDD	11	88
AFA	11	88
GKP	11	88
NFL	11	88
LYA	11	88
DAD	11	88
AAN	11	88
LHD	11	88
TVT	11	88
GTV	11	88
TVS	11	88
DAS	11	88
DVT	11	88
SFD	11	88
SNS	11	87
VDV	11	87
GVD	11	87
EPL	11	87
SDE	11	87
LVH	11	87
SVP	11	87
PAA	11	87
TAT	11	87
YTL	11	86
VAQ	11	86
FTL	11	86
RPL	11	86
NGD	11	86
TTG	11	86
VAN	11	86
DTS	11	86
TSG	11	86
AKP	11	86
EVD	11	86
ATV	11	85
ALM	11	85
ANA	11	85
GVV	11	85
GHL	11	85
KVE	11	85
SVG	11	85
DVS	11	85
PVL	11	85
PLV	11	85
EAD	11	85
KAE	11	85
DDA	11	85
ATS	11	85
FGV	11	85
KLP	11	85
SLK	11	84
HAL	11	84
DKL	11	84
NLQ	11	84
AEG	11	84
SKP	11	84
EDD	11	84
SEE	11	84
GLY	11	84
TAS	11	83
ATD	11	83
AST	11	83
EGD	11	83
AAF	11	83
VFL	11	83
DEA	11	83
AHL	11	83
TAG	11	83
ESV	11	83
LEP	11	82
SGV	11	82
TFL	11	82
GGD	11	82
LLM	11	82
AVN	11	82
NQL	11	82
GEV	11	82
KAL	11	82
LMD	11	82
DSD	11	82
SEN	11	82
SES	11	82
LPN	11	82
ADG	11	81
LHV	11	81
YGS	11	81
DGN	11	81
VEQ	11	81
YGG	11	81
TPV	11	81
TGV	11	81
YSD	11	81
TAV	11	81
NHL	11	81
ESE	11	81
DYL	11	81
STV	11	80
EVV	11	80
HLP	11	80
SDA	11	80
FSA	11	80
FVD	11	80
EEV	11	80
EYL	11	80
DDS	11	80
LAY	11	80
LQN	11	80
VGG	11	80
LPF	11	80
SFS	11	80
LRD	11	80
PAG	11	79
TGD	11	79
GYG	11	79
AML	11	79
ESS	11	79
KPA	11	79
DPL	11	79
ATE	11	79
VEG	11	79
VTG	11	79
AFD	11	79
VNP	11	79
ADA	11	79
VPG	11	79
TKP	10	78
GAE	10	78
NPE	10	78
LAF	10	78
NVV	10	78
MAL	10	78
GPG	10	78
MLN	10	78
QAA	10	78
AQV	10	78
VPT	10	78
YLT	10	78
TPS	10	77
GVT	10	77
TGG	10	77
ETV	10	77
DVP	10	77
LFQ	10	77
LWD	10	77
FLQ	10	77
GDV	10	77
EVS	10	77
DLY	10	77
FTD	10	77
AEQ	10	77
HVV	10	77
DST	10	77
TVV	10	77
AAY	10	76
DDG	10	76
LHA	10	76
VLY	10	76
EGS	10	76
TVD	10	76
VSQ	10	75
YDL	10	75
KLN	10	75
YLQ	10	75
LHG	10	75
VFD	10	75
TTS	10	75
EGV	10	75
VNS	10	75
LEH	10	75
LHT	10	75
TFE	10	75
STE	10	75
SED	10	75
ASP	10	75
VEV	10	75
VNV	10	75
SSN	10	75
AGN	10	75
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EAS	10	74
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PAL	10	74
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AES	10	74
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NSS	10	73
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FEE	10	69
FGE	10	69
EAP	10	69
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VDS	9	68
GSD	9	68
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DEG	9	68
QNL	9	68
DTE	9	68
ASN	9	68
DTT	9	68
LEF	9	68
FVA	9	68
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AVP	9	68
ATT	9	68
LHP	9	68
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TSE	9	68
PLS	9	68
DSN	9	68
GAS	9	67
SYE	9	67
LAM	9	67
DTD	9	67
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GSA	9	67
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HEL	9	67
YSL	9	67
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STD	9	67
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AVQ	9	67
MLG	9	67
SNE	9	67
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PLT	9	66
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ASQ	9	66
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EET	9	66
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GGT	9	65
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TTE	9	65
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SQS	9	65
GSF	9	65
SEG	9	65
SML	9	65
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PLE	9	64
VNE	9	64
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PLD	9	64
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TFS	9	64
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SAN	9	62
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LYH	9	62
RLL	9	62
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ANE	9	62
FDA	9	62
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AET	9	62
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ESG	9	61
SPD	9	61
VFE	9	61
HLY	9	61
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KLT	9	61
EST	9	61
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GSE	9	61
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PSL	9	60
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TML	9	60
MLV	9	60
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TDD	9	60
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TSA	9	60
SYG	9	60
TGP	8	59
LKN	8	59
TDT	8	59
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FAN	8	59
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SGN	8	59
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STQ	8	57
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SQG	8	56
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FGS	8	55
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GDE	8	54
GDD	8	54
NLY	8	54
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DVQ	8	54
YSE	8	54
HGE	8	54
STF	8	54
GTD	8	54
HVE	8	54
MPL	8	54
LMA	8	54
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NSA	8	54
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GES	8	54
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FGF	8	53
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QAS	7	51
NAT	7	51
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DEN	7	51
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