1exf_a.dssp

This the implementation of structural SVM for training complex alignment models for protein sequence

1EXF_A
241
V X 113
S X 55
A H 76
E H 156
E H 112
I H 32
K H 126
K H 118
H H 2
E H 93
E H 124
K H 48
W H 39
N H 102
K H 98
Y H 1
Y H 68
G S 43
V S 78
N X 93
A G 18
F G 126
N G 121
L S 14
P X 56
K T 170
E T 130
L T 17
F E 12
S E 32
K E 73
V X 5
D X 81
E T 142
K T 164
D G 63
R G 26
Q G 104
K S 124
Y T 91
P T 18
Y G 45
N G 14
T G 0
I E 0
G E 0
N E 1
V E 2
F E 56
V E 2
K T 139
G T 64
Q T 118
T E 41
S E 8
A E 0
T E 0
G E 0
V E 0
L E 0
I X 7
G S 5
K S 118
N S 29
T E 0
V E 0
L E 0
T E 0
N X 0
R H 43
H H 57
I H 5
A H 5
K G 95
F G 83
A G 4
N T 146
G T 53
D X 57
P G 36
S G 93
K G 99
V E 8
S E 24
F E 3
R E 28
P E 0
S T 1
I X 2
N E 14
T E 21
D X 58
D T 115
N T 135
G S 51
N X 90
T E 70
E E 130
T X 36
P T 62
Y T 30
G X 22
E X 89
Y E 0
E E 108
V E 6
K E 98
E E 75
I E 29
L E 20
Q S 57
E X 76
P T 30
F T 3
G X 31
A T 53
G T 82
V S 34
D X 30
L X 2
A E 0
L E 1
I E 4
R E 30
L E 3
K X 104
P X 59
D X 13
Q T 156
N T 127
G S 55
V X 55
S X 22
L G 1
G G 11
D G 96
K T 84
I S 13
S X 84
P X 41
A X 6
K E 130
I E 31
G X 3
T X 36
S G 30
N G 135
D G 121
L X 20
K X 146
D T 91
G T 41
D X 57
K E 119
L E 13
E E 57
L E 0
I E 3
G E 0
Y X 1
P X 0
F T 81
D T 94
H T 35
K S 47
V T 72
N T 18
Q X 11
M X 0
H E 9
R E 31
S E 0
E E 38
I E 0
E E 22
L E 1
T E 23
T X 43
L G 45
S G 117
R G 187
G S 32
L E 14
R E 37
Y E 0
Y E 15
G X 0
F X 20
T X 1
V X 19
P G 88
G G 3
N G 1
S T 8
G T 0
S X 0
G E 0
I E 0
F E 4
N X 32
S T 123
N T 131
G S 13
E E 45
L E 0
V E 0
G E 0
I E 1
H E 3
S E 3
S E 47
K E 56
V E 40
S E 69
H X 12
L S 56
D S 50
R T 227
E T 160
H X 36
Q E 99
I E 0
N E 0
Y E 77
G E 2
V E 15
G E 23
I X 1
G X 25
N H 139
Y H 113
V H 10
K H 69
R H 122
I H 13
I H 2
N H 119
E H 114
K H 85
N X 62
E X 86