rna_alphabet.cpp

ViennaRNA-1.6.1

#include "rna_alphabet.h"

#include <cassert>

int alpha2RNA_Alpha(char c)
{
	switch(c)
	{
		case ALPHA_BASE_A:
			return ALPHA_PRO_BASE_A;
		case ALPHA_BASE_C:
			return ALPHA_PRO_BASE_C;
		case ALPHA_BASE_G:
			return ALPHA_PRO_BASE_G;
		case ALPHA_BASE_U:
			return ALPHA_PRO_BASE_U;
		case ALPHA_GAP:
			return ALPHA_PRO_GAP;
		case ALPHA_BASEPAIR:
			return ALPHA_PRO_BASEPAIR;
		case ALPHA_BASE:
			return ALPHA_PRO_BASE;
		default:
			assert(true);
	}

	return 0;	// never reached !!
}