sint2.dgd

mfold

Data table for symetric interior loops of size 2 
Free energies at 37 degrees for DNA 
Data Arrangement: 
 
            Y 
    ------------------ 
(X)  A    C    G    T   
    ------------------ 
        5' --> 3' 
            X 
           A A 
           T T 
            Y 
        3' <-- 5' 
(A)  .    .    .    .    
(C)  .    .    .    .    
(G)  .    .    .    .    
(T)  .    .    .    .    
 
 
   
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3' 
            X                       X                       X                       X                       X                       X 
           A A                     A C                     A G                     A T                     A G                     A T         
           T T                     T G                     T C                     T A                     T T                     T G         
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5' 
  1.30  2.21  0.88  1.00  0.78  1.35 -0.38  1.00  1.04  1.67  0.25  1.00  1.22  1.65  0.16  1.00  2.04  2.67  1.25  1.00  1.78  2.35  0.62  1.00 
  1.69  2.38  1.00  1.39  1.58  2.12  1.00  1.62  1.52  2.03  1.00  1.04  1.65  2.66  1.00  1.37  2.52  3.03  1.00  2.04  2.58  3.12  1.00  2.62 
  0.44  1.00  0.31  2.00 -0.24  1.00 -1.24  2.00  0.05  1.00 -0.24  2.00  0.16  1.00 -0.26  2.00  1.05  1.00  0.76  2.00  0.76  1.00 -0.24  2.00 
  1.00  1.70  2.00  1.37  1.00  1.35  2.00  1.14  1.00  1.35  2.00  0.57  1.00  1.37  2.00  1.38  1.00  2.35  2.00  1.57  1.00  2.35  2.00  2.14 
   
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3' 
            X                       X                       X                       X                       X                       X 
           C A                     C C                     C G                     C T                     C G                     C T         
           G T                     G G                     G C                     G A                     G T                     G G         
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5' 
  1.12  2.08  0.77  1.00  0.60  1.22 -0.49  1.00  0.86  1.54  0.14  1.00  1.04  1.52  0.05  1.00  1.86  2.54  1.14  1.00  1.60  2.22  0.51  1.00 
  1.71  1.75  1.00  1.37  1.60  1.49  1.00  1.60  1.54  1.40  1.00  1.02  1.67  2.03  1.00  1.35  2.54  2.40  1.00  2.02  2.60  2.49  1.00  2.60 
  0.53  1.00  0.33  2.00 -0.14  1.00 -1.22  2.00  0.14  1.00 -0.22  2.00  0.25  1.00 -0.24  2.00  1.14  1.00  0.78  2.00  0.86  1.00 -0.22  2.00 
  1.00  1.37  2.00  0.56  1.00  1.02  2.00  0.33  1.00  1.02  2.00 -0.24  1.00  1.04  2.00  0.57  1.00  2.02  2.00  0.76  1.00  2.02  2.00  1.33 
   
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3' 
            X                       X                       X                       X                       X                       X 
           G A                     G C                     G G                     G T                     G G                     G T         
           C T                     C G                     C C                     C A                     C T                     C G         
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5' 
  0.86  2.14  0.49  1.00  0.34  1.28 -0.78  1.00  0.60  1.60 -0.14  1.00  0.78  1.58 -0.24  1.00  1.60  2.60  0.86  1.00  1.34  2.28  0.22  1.00 
  1.39  1.84  1.00  1.37  1.28  1.58  1.00  1.60  1.22  1.49  1.00  1.02  1.35  2.12  1.00  1.35  2.22  2.49  1.00  2.02  2.28  2.58  1.00  2.60 
 -0.10  1.00 -0.67  2.00 -0.78  1.00 -2.22  2.00 -0.49  1.00 -1.22  2.00 -0.38  1.00 -1.24  2.00  0.51  1.00 -0.22  2.00  0.22  1.00 -1.22  2.00 
  1.00  1.95  2.00  1.13  1.00  1.60  2.00  0.90  1.00  1.60  2.00  0.33  1.00  1.62  2.00  1.14  1.00  2.60  2.00  1.33  1.00  2.60  2.00  1.90 
   
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3' 
            X                       X                       X                       X                       X                       X 
           T A                     T C                     T G                     T T                     T G                     T T         
           A T                     A G                     A C                     A A                     A T                     A G         
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5' 
  1.38  2.25  1.16  1.00  0.86  1.39 -0.10  1.00  1.12  1.71  0.53  1.00  1.30  1.69  0.44  1.00  2.12  2.71  1.53  1.00  1.86  2.39  0.90  1.00 
  2.25  2.05  1.00  1.72  2.14  1.84  1.00  1.95  2.08  1.75  1.00  1.37  2.21  2.38  1.00  1.70  3.08  2.75  1.00  2.37  3.14  2.84  1.00  2.95 
  1.16  1.00  0.88  2.00  0.49  1.00 -0.67  2.00  0.77  1.00  0.33  2.00  0.88  1.00  0.31  2.00  1.77  1.00  1.33  2.00  1.49  1.00  0.33  2.00 
  1.00  1.72  2.00  1.36  1.00  1.37  2.00  1.13  1.00  1.37  2.00  0.56  1.00  1.39  2.00  1.37  1.00  2.37  2.00  1.56  1.00  2.37  2.00  2.13 
   
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------ 
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3' 
            X                       X                       X                       X                       X                       X 
           G A                     G C                     G G                     G T                     G G                     G T         
           T T                     T G                     T C                     T A                     T T                     T G         
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y 
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