sint4.ent

mfold

Data tables for symetric interior loops of size 4                                               
Free energies at entdegrees for DNA                                                             
Data arrangement:                                                                               
                                               Y                                                
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
(X) A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T 
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T 
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
                                          5' ------> 3'                                         
                                           A \/ \_/ A                                           
                                           T /\  |  T                                           
                                          3' <------ 5'                                         
(AA)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(AC)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(AG)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(AT)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(CA)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(CC)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(CG)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(CT)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(GA)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(GC)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(GG)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(GT)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(TA)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(TC)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(TG)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
(TT)  .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     .     
                                                                                                
                                               Y                                                
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T 
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T 
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
                                          5' ------> 3'                                         
                                           A \/ \_/ A                                           
                                           T /\  |  T                                           
                                          3' <------ 5'                                         
 -1.87 -1.90 -1.87 -3.97 -1.90 -1.97 -4.16 -1.93 -1.87 -3.90 -1.87 -1.81 -3.74 -1.93 -1.45 -1.87
 -1.93 -1.97 -1.93 -4.03 -1.97 -2.03 -4.22 -2.00 -1.93 -3.97 -1.93 -1.87 -3.80 -2.00 -1.52 -1.93
 -1.90 -1.93 -1.90 -4.00 -1.93 -2.00 -4.19 -1.97 -1.90 -3.93 -1.90 -1.84 -3.77 -1.97 -1.48 -1.90
 -4.00 -4.03 -4.00 -6.09 -4.03 -4.09 -6.29 -4.06 -4.00 -6.03 -4.00 -3.93 -5.87 -4.06 -3.58 -4.00
 -1.93 -1.97 -1.93 -4.03 -1.97 -2.03 -4.22 -2.00 -1.93 -3.97 -1.93 -1.87 -3.80 -2.00 -1.52 -1.93
 -2.00 -2.03 -2.00 -4.09 -2.03 -2.10 -4.29 -2.06 -2.00 -4.03 -2.00 -1.93 -3.87 -2.06 -1.58 -2.00
 -4.03 -4.06 -4.03 -6.13 -4.06 -4.13 -6.32 -4.09 -4.03 -6.06 -4.03 -3.97 -5.90 -4.09 -3.61 -4.03
 -1.97 -2.00 -1.97 -4.06 -2.00 -2.06 -4.26 -2.03 -1.97 -4.00 -1.97 -1.90 -3.84 -2.03 -1.55 -1.97
 -1.90 -1.93 -1.90 -4.00 -1.93 -2.00 -4.19 -1.97 -1.90 -3.93 -1.90 -1.84 -3.77 -1.97 -1.48 -1.90
 -3.90 -3.93 -3.90 -6.00 -3.93 -4.00 -6.19 -3.97 -3.90 -5.93 -3.90 -3.84 -5.77 -3.97 -3.48 -3.90
 -1.90 -1.93 -1.90 -4.00 -1.93 -2.00 -4.19 -1.97 -1.90 -3.93 -1.90 -1.84 -3.77 -1.97 -1.48 -1.90
 -1.13 -1.16 -1.13 -3.22 -1.16 -1.23 -3.42 -1.19 -1.13 -3.16 -1.13 -1.06 -3.00 -1.19 -0.71 -1.13
 -3.77 -3.80 -3.77 -5.87 -3.80 -3.87 -6.06 -3.84 -3.77 -5.80 -3.77 -3.71 -5.64 -3.84 -3.35 -3.77
 -1.97 -2.00 -1.97 -4.06 -2.00 -2.06 -4.26 -2.03 -1.97 -4.00 -1.97 -1.90 -3.84 -2.03 -1.55 -1.97
 -2.26 -2.29 -2.26 -4.35 -2.29 -2.35 -4.55 -2.32 -2.26 -4.29 -2.26 -2.19 -4.13 -2.32 -1.84 -2.26
 -1.90 -1.93 -1.90 -4.00 -1.93 -2.00 -4.19 -1.97 -1.90 -3.93 -1.90 -1.84 -3.77 -1.97 -1.48 -1.90
                                                                                                
                                               Y                                                
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T 
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T 
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
                                          5' ------> 3'                                         
                                           A \/ \_/ C                                           
                                           T /\  |  G                                           
                                          3' <------ 5'                                         
 -2.35 -2.45 -2.39 -4.00 -2.45 -2.51 -3.74 -2.48 -2.39 -4.16 -2.39 -2.71 -3.90 -2.48 -0.26 -2.42
 -2.42 -2.51 -2.45 -4.06 -2.51 -2.58 -3.80 -2.55 -2.45 -4.22 -2.45 -2.77 -3.97 -2.55 -0.32 -2.48
 -2.39 -2.48 -2.42 -4.03 -2.48 -2.55 -3.77 -2.51 -2.42 -4.19 -2.42 -2.74 -3.93 -2.51 -0.29 -2.45
 -4.48 -4.58 -4.51 -6.13 -4.58 -4.64 -5.87 -4.61 -4.51 -6.29 -4.51 -4.84 -6.03 -4.61 -2.39 -4.55
 -2.42 -2.51 -2.45 -4.06 -2.51 -2.58 -3.80 -2.55 -2.45 -4.22 -2.45 -2.77 -3.97 -2.55 -0.32 -2.48
 -2.48 -2.58 -2.51 -4.13 -2.58 -2.64 -3.87 -2.61 -2.51 -4.29 -2.51 -2.84 -4.03 -2.61 -0.39 -2.55
 -4.51 -4.61 -4.55 -6.16 -4.61 -4.68 -5.90 -4.64 -4.55 -6.32 -4.55 -4.87 -6.06 -4.64 -2.42 -4.58
 -2.45 -2.55 -2.48 -4.09 -2.55 -2.61 -3.84 -2.58 -2.48 -4.26 -2.48 -2.81 -4.00 -2.58 -0.35 -2.51
 -2.39 -2.48 -2.42 -4.03 -2.48 -2.55 -3.77 -2.51 -2.42 -4.19 -2.42 -2.74 -3.93 -2.51 -0.29 -2.45
 -4.38 -4.48 -4.42 -6.03 -4.48 -4.55 -5.77 -4.51 -4.42 -6.19 -4.42 -4.74 -5.93 -4.51 -2.29 -4.45
 -2.39 -2.48 -2.42 -4.03 -2.48 -2.55 -3.77 -2.51 -2.42 -4.19 -2.42 -2.74 -3.93 -2.51 -0.29 -2.45
 -1.61 -1.71 -1.64 -3.26 -1.71 -1.77 -3.00 -1.74 -1.64 -3.42 -1.64 -1.97 -3.16 -1.74  0.48 -1.68
 -4.26 -4.35 -4.29 -5.90 -4.35 -4.42 -5.64 -4.38 -4.29 -6.06 -4.29 -4.61 -5.80 -4.38 -2.16 -4.32
 -2.45 -2.55 -2.48 -4.09 -2.55 -2.61 -3.84 -2.58 -2.48 -4.26 -2.48 -2.81 -4.00 -2.58 -0.35 -2.51
 -2.74 -2.84 -2.77 -4.38 -2.84 -2.90 -4.13 -2.87 -2.77 -4.55 -2.77 -3.10 -4.29 -2.87 -0.64 -2.81
 -2.39 -2.48 -2.42 -4.03 -2.48 -2.55 -3.77 -2.51 -2.42 -4.19 -2.42 -2.74 -3.93 -2.51 -0.29 -2.45
                                                                                                
                                               Y                                                
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T 
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T 
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
                                          5' ------> 3'                                         
                                           A \/ \_/ G                                           
                                           T /\  |  C                                           
                                          3' <------ 5'                                         
 -2.39 -2.48 -2.42 -3.87 -2.48 -2.55 -4.48 -2.48 -2.42 -3.74 -2.42 -2.19 -4.03 -2.48 -2.58 -2.42
 -2.45 -2.55 -2.48 -3.93 -2.55 -2.61 -4.55 -2.55 -2.48 -3.80 -2.48 -2.26 -4.09 -2.55 -2.64 -2.48
 -2.42 -2.51 -2.45 -3.90 -2.51 -2.58 -4.51 -2.51 -2.45 -3.77 -2.45 -2.22 -4.06 -2.51 -2.61 -2.45
 -4.51 -4.61 -4.55 -6.00 -4.61 -4.68 -6.61 -4.61 -4.55 -5.87 -4.55 -4.32 -6.16 -4.61 -4.71 -4.55
 -2.45 -2.55 -2.48 -3.93 -2.55 -2.61 -4.55 -2.55 -2.48 -3.80 -2.48 -2.26 -4.09 -2.55 -2.64 -2.48
 -2.51 -2.61 -2.55 -4.00 -2.61 -2.68 -4.61 -2.61 -2.55 -3.87 -2.55 -2.32 -4.16 -2.61 -2.71 -2.55
 -4.55 -4.64 -4.58 -6.03 -4.64 -4.71 -6.64 -4.64 -4.58 -5.90 -4.58 -4.35 -6.19 -4.64 -4.74 -4.58
 -2.48 -2.58 -2.51 -3.97 -2.58 -2.64 -4.58 -2.58 -2.51 -3.84 -2.51 -2.29 -4.13 -2.58 -2.68 -2.51
 -2.42 -2.51 -2.45 -3.90 -2.51 -2.58 -4.51 -2.51 -2.45 -3.77 -2.45 -2.22 -4.06 -2.51 -2.61 -2.45
 -4.42 -4.51 -4.45 -5.90 -4.51 -4.58 -6.51 -4.51 -4.45 -5.77 -4.45 -4.22 -6.06 -4.51 -4.61 -4.45
 -2.42 -2.51 -2.45 -3.90 -2.51 -2.58 -4.51 -2.51 -2.45 -3.77 -2.45 -2.22 -4.06 -2.51 -2.61 -2.45
 -1.64 -1.74 -1.68 -3.13 -1.74 -1.81 -3.74 -1.74 -1.68 -3.00 -1.68 -1.45 -3.29 -1.74 -1.84 -1.68
 -4.29 -4.38 -4.32 -5.77 -4.38 -4.45 -6.38 -4.38 -4.32 -5.64 -4.32 -4.09 -5.93 -4.38 -4.48 -4.32
 -2.48 -2.58 -2.51 -3.97 -2.58 -2.64 -4.58 -2.58 -2.51 -3.84 -2.51 -2.29 -4.13 -2.58 -2.68 -2.51
 -2.77 -2.87 -2.81 -4.26 -2.87 -2.93 -4.87 -2.87 -2.81 -4.13 -2.81 -2.58 -4.42 -2.87 -2.97 -2.81
 -2.42 -2.51 -2.45 -3.90 -2.51 -2.58 -4.51 -2.51 -2.45 -3.77 -2.45 -2.22 -4.06 -2.51 -2.61 -2.45
                                                                                                
                                               Y                                                
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T 
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T 
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
                                          5' ------> 3'                                         
                                           A \/ \_/ T                                           
                                           T /\  |  A                                           
                                          3' <------ 5'                                         
 -1.84 -1.90 -1.87 -3.74 -1.90 -1.97 -3.87 -1.93 -1.87 -4.00 -1.87 -2.22 -3.97 -1.93 -1.10 -1.87
 -1.90 -1.97 -1.93 -3.80 -1.97 -2.03 -3.93 -2.00 -1.93 -4.06 -1.93 -2.29 -4.03 -2.00 -1.16 -1.93
 -1.87 -1.93 -1.90 -3.77 -1.93 -2.00 -3.90 -1.97 -1.90 -4.03 -1.90 -2.26 -4.00 -1.97 -1.13 -1.90
 -3.97 -4.03 -4.00 -5.87 -4.03 -4.09 -6.00 -4.06 -4.00 -6.13 -4.00 -4.35 -6.09 -4.06 -3.22 -4.00
 -1.90 -1.97 -1.93 -3.80 -1.97 -2.03 -3.93 -2.00 -1.93 -4.06 -1.93 -2.29 -4.03 -2.00 -1.16 -1.93
 -1.97 -2.03 -2.00 -3.87 -2.03 -2.10 -4.00 -2.06 -2.00 -4.13 -2.00 -2.35 -4.09 -2.06 -1.23 -2.00
 -4.00 -4.06 -4.03 -5.90 -4.06 -4.13 -6.03 -4.09 -4.03 -6.16 -4.03 -4.38 -6.13 -4.09 -3.26 -4.03
 -1.93 -2.00 -1.97 -3.84 -2.00 -2.06 -3.97 -2.03 -1.97 -4.09 -1.97 -2.32 -4.06 -2.03 -1.19 -1.97
 -1.87 -1.93 -1.90 -3.77 -1.93 -2.00 -3.90 -1.97 -1.90 -4.03 -1.90 -2.26 -4.00 -1.97 -1.13 -1.90
 -3.87 -3.93 -3.90 -5.77 -3.93 -4.00 -5.90 -3.97 -3.90 -6.03 -3.90 -4.26 -6.00 -3.97 -3.13 -3.90
 -1.87 -1.93 -1.90 -3.77 -1.93 -2.00 -3.90 -1.97 -1.90 -4.03 -1.90 -2.26 -4.00 -1.97 -1.13 -1.90
 -1.10 -1.16 -1.13 -3.00 -1.16 -1.23 -3.13 -1.19 -1.13 -3.26 -1.13 -1.48 -3.22 -1.19 -0.35 -1.13
 -3.74 -3.80 -3.77 -5.64 -3.80 -3.87 -5.77 -3.84 -3.77 -5.90 -3.77 -4.13 -5.87 -3.84 -3.00 -3.77
 -1.93 -2.00 -1.97 -3.84 -2.00 -2.06 -3.97 -2.03 -1.97 -4.09 -1.97 -2.32 -4.06 -2.03 -1.19 -1.97
 -2.22 -2.29 -2.26 -4.13 -2.29 -2.35 -4.26 -2.32 -2.26 -4.38 -2.26 -2.61 -4.35 -2.32 -1.48 -2.26
 -1.87 -1.93 -1.90 -3.77 -1.93 -2.00 -3.90 -1.97 -1.90 -4.03 -1.90 -2.26 -4.00 -1.97 -1.13 -1.90
                                                                                                
                                               Y                                                
   ---------------------------------------------------------------------------------------------
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T