sint2.ent

mfold

Data table for symetric interior loops of size 2  
Free energies at entdegrees for DNA               
Data Arrangement:                                 
                                                  
            Y                                     
    ------------------                            
(X)  A    C    G    T                             
    ------------------                            
        5' --> 3'                                 
            X                                     
           A A                                    
           T T                                    
            Y                                     
        3' <-- 5'                                 
(A)  .    .    .    .                             
(C)  .    .    .    .                             
(G)  .    .    .    .                             
(T)  .    .    .    .                             
                                                                                                                                                
                                                                                                                                                
                                                                                                                                                
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'       
            X                       X                       X                       X                       X                       X           
           A A                     A C                     A G                     A T                     A G                     A T          
           T T                     T G                     T C                     T A                     T T                     T G          
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'       
  1.45  2.48  0.49 -0.32 -0.80  0.08  0.09 -0.32 -0.24  0.40 -1.56 -0.32  0.35  1.92 -0.47 -0.32 -0.66 -0.86 -0.40 -0.32 -0.57 -0.76 -0.20 -0.32
  2.26  1.20 -0.32  0.10  2.88  0.44 -0.32  1.38  1.83 -1.17 -0.32 -0.59  1.92 -0.89 -0.32 -0.60 -0.81 -0.98 -0.32 -0.66 -0.83 -1.01 -0.32 -0.84
 -0.14 -0.32 -0.71 -0.64 -0.31 -0.32 -2.73 -0.64 -0.47 -0.32 -2.47 -0.64 -0.47 -0.32 -2.04 -0.64 -0.34 -0.32 -0.25 -0.64 -0.25 -0.32  0.08 -0.64
 -0.32 -0.55 -0.64 -1.25 -0.32 -0.08 -0.64 -1.92 -0.32 -1.08 -0.64 -2.67 -0.32 -0.60 -0.64 -2.15 -0.32 -0.76 -0.64 -0.51 -0.32 -0.76 -0.64 -0.69
                                                                                                                                                
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'       
            X                       X                       X                       X                       X                       X           
           C A                     C C                     C G                     C T                     C G                     C T          
           G T                     G G                     G C                     G A                     G T                     G G          
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'       
  0.86  2.39  0.49 -0.32 -1.39 -0.01  0.09 -0.32 -0.83  0.31 -1.56 -0.32 -0.24  1.83 -0.47 -0.32 -0.60 -0.82 -0.37 -0.32 -0.52 -0.72 -0.16 -0.32
  0.74  0.92 -0.32 -0.38  1.35  0.16 -0.32  0.90  0.31 -1.42 -0.32 -1.07  0.40 -1.17 -0.32 -1.08 -0.82 -0.77 -0.32 -0.65 -0.84 -0.80 -0.32 -0.84
 -1.23 -0.32 -1.14 -0.64 -1.44 -0.32 -3.15 -0.64 -1.56 -0.32 -2.90 -0.64 -1.56 -0.32 -2.47 -0.64 -0.37 -0.32 -0.25 -0.64 -0.28 -0.32  0.07 -0.64
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            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'       
            X                       X                       X                       X                       X                       X           
           G A                     G C                     G G                     G T                     G G                     G T          
           C T                     C G                     C C                     C A                     C T                     C G          
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'       
  0.30  3.44  0.65 -0.32 -1.95  1.04  0.22 -0.32 -1.39  1.35 -1.44 -0.32 -0.80  2.88 -0.31 -0.32 -0.52 -0.84 -0.28 -0.32 -0.43 -0.74 -0.07 -0.32
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            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
     A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T        A    C    G    T   
    ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------      ------------------  
        5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'               5' --> 3'       
            X                       X                       X                       X                       X                       X           
           T A                     T C                     T G                     T T                     T G                     T T          
           A T                     A G                     A C                     A A                     A T                     A G          
            Y                       Y                       Y                       Y                       Y                       Y           
        3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'               3' <-- 5'       
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