sint4.dhd

mfold

-10.60-10.60-10.60 -9.60-10.60-10.60-14.70-10.60-10.60 -7.30-10.60 -4.80-10.70-10.60-12.00-10.60 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.10 -4.10 -4.10 -3.10 -4.10 -4.10 -8.20 -4.10 -4.10 -0.80 -4.10  1.70 -4.20 -4.10 -5.50 -4.10 
 -7.80 -7.80 -7.80 -6.80 -7.80 -7.80-11.90 -7.80 -7.80 -4.50 -7.80 -2.00 -7.90 -7.80 -9.20 -7.80 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -2.80 -2.80 -2.80 -1.80 -2.80 -2.80 -6.90 -2.80 -2.80  0.50 -2.80  3.00 -2.90 -2.80 -4.20 -2.80 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           C \/ \_/ T 
                                           G /\  |  G 
                                          3' <------ 5' 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -8.50 -8.50 -8.50-11.00 -8.50 -8.50-11.30 -8.50 -8.50 -4.10 -8.50 -4.40 -9.80 -8.50 -2.70 -8.50 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-10.50 -8.00 -8.00-10.80 -8.00 -8.00 -3.60 -8.00 -3.90 -9.30 -8.00 -2.20 -8.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
-10.60-10.60-10.60-13.10-10.60-10.60-13.40-10.60-10.60 -6.20-10.60 -6.50-11.90-10.60 -4.80-10.60 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -4.10 -4.10 -4.10 -6.60 -4.10 -4.10 -6.90 -4.10 -4.10  0.30 -4.10  0.00 -5.40 -4.10  1.70 -4.10 
 -7.80 -7.80 -7.80-10.30 -7.80 -7.80-10.60 -7.80 -7.80 -3.40 -7.80 -3.70 -9.10 -7.80 -2.00 -7.80 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 -2.80 -2.80 -2.80 -5.30 -2.80 -2.80 -5.60 -2.80 -2.80  1.60 -2.80  1.30 -4.10 -2.80  3.00 -2.80 
 -4.00 -4.00 -4.00 -6.50 -4.00 -4.00 -6.80 -4.00 -4.00  0.40 -4.00  0.10 -5.30 -4.00  1.80 -4.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           G \/ \_/ A 
                                           C /\  |  T 
                                          3' <------ 5' 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
-10.20-10.20-10.20-16.10-10.20-10.20-16.70-10.20-10.20-16.40-10.20 -9.50-15.40-10.20 -8.30-10.20 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
-11.80-11.80-11.80-17.70-11.80-11.80-18.30-11.80-11.80-18.00-11.80-11.10-17.00-11.80 -9.90-11.80 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
-10.00-10.00-10.00-15.90-10.00-10.00-16.50-10.00-10.00-16.20-10.00 -9.30-15.20-10.00 -8.10-10.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
  1.30  1.30  1.30 -4.60  1.30  1.30 -5.20  1.30  1.30 -4.90  1.30  2.00 -3.90  1.30  3.20  1.30 
-10.40-10.40-10.40-16.30-10.40-10.40-16.90-10.40-10.40-16.60-10.40 -9.70-15.60-10.40 -8.50-10.40 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.40 -6.40 -6.40-12.30 -6.40 -6.40-12.90 -6.40 -6.40-12.60 -6.40 -5.70-11.60 -6.40 -4.50 -6.40 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           G \/ \_/ C 
                                           C /\  |  G 
                                          3' <------ 5' 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
-12.20-12.20-12.20-16.60-12.20-12.20-16.20-12.20-12.20-18.00-12.20-12.60-16.40-12.20 -4.90-12.20 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
-13.80-13.80-13.80-18.20-13.80-13.80-17.80-13.80-13.80-19.60-13.80-14.20-18.00-13.80 -6.50-13.80 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
-12.00-12.00-12.00-16.40-12.00-12.00-16.00-12.00-12.00-17.80-12.00-12.40-16.20-12.00 -4.70-12.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -0.70 -0.70 -0.70 -5.10 -0.70 -0.70 -4.70 -0.70 -0.70 -6.50 -0.70 -1.10 -4.90 -0.70  6.60 -0.70 
-12.40-12.40-12.40-16.80-12.40-12.40-16.40-12.40-12.40-18.20-12.40-12.80-16.60-12.40 -5.10-12.40 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.40 -8.40 -8.40-12.80 -8.40 -8.40-12.40 -8.40 -8.40-14.20 -8.40 -8.80-12.60 -8.40 -1.10 -8.40 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           G \/ \_/ G 
                                           C /\  |  C 
                                          3' <------ 5' 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
-12.20-12.20-12.20-16.00-12.20-12.20-18.80-12.20-12.20-16.20-12.20-11.00-16.70-12.20-12.30-12.20 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
-13.80-13.80-13.80-17.60-13.80-13.80-20.40-13.80-13.80-17.80-13.80-12.60-18.30-13.80-13.90-13.80 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
-12.00-12.00-12.00-15.80-12.00-12.00-18.60-12.00-12.00-16.00-12.00-10.80-16.50-12.00-12.10-12.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -0.70 -0.70 -0.70 -4.50 -0.70 -0.70 -7.30 -0.70 -0.70 -4.70 -0.70  0.50 -5.20 -0.70 -0.80 -0.70 
-12.40-12.40-12.40-16.20-12.40-12.40-19.00-12.40-12.40-16.40-12.40-11.20-16.90-12.40-12.50-12.40 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.40 -8.40 -8.40-12.20 -8.40 -8.40-15.00 -8.40 -8.40-12.40 -8.40 -7.20-12.90 -8.40 -8.50 -8.40 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           G \/ \_/ T 
                                           C /\  |  A 
                                          3' <------ 5' 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
-10.20-10.20-10.20-15.40-10.20-10.20-16.00-10.20-10.20-16.60-10.20-10.70-16.10-10.20 -7.20-10.20 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
-11.80-11.80-11.80-17.00-11.80-11.80-17.60-11.80-11.80-18.20-11.80-12.30-17.70-11.80 -8.80-11.80 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
-10.00-10.00-10.00-15.20-10.00-10.00-15.80-10.00-10.00-16.40-10.00-10.50-15.90-10.00 -7.00-10.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
  1.30  1.30  1.30 -3.90  1.30  1.30 -4.50  1.30  1.30 -5.10  1.30  0.80 -4.60  1.30  4.30  1.30 
-10.40-10.40-10.40-15.60-10.40-10.40-16.20-10.40-10.40-16.80-10.40-10.90-16.30-10.40 -7.40-10.40 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.40 -6.40 -6.40-11.60 -6.40 -6.40-12.20 -6.40 -6.40-12.80 -6.40 -6.90-12.30 -6.40 -3.40 -6.40 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           G \/ \_/ G 
                                           C /\  |  T 
                                          3' <------ 5' 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -8.20 -8.20 -8.20 -7.20 -8.20 -8.20-12.30 -8.20 -8.20 -4.90 -8.20 -2.40 -8.30 -8.20 -9.60 -8.20 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -9.80 -9.80 -9.80 -8.80 -9.80 -9.80-13.90 -9.80 -9.80 -6.50 -9.80 -4.00 -9.90 -9.80-11.20 -9.80 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00