sint4.dhd

mfold

 -2.00 -2.00 -2.00 -1.00 -2.00 -2.00 -6.10 -2.00 -2.00  1.30 -2.00  3.80 -2.10 -2.00 -3.40 -2.00 
  1.00  1.00  1.00  2.00  1.00  1.00 -3.10  1.00  1.00  4.30  1.00  6.80  0.90  1.00 -0.40  1.00 
 -7.20 -7.20 -7.20 -6.20 -7.20 -7.20-11.30 -7.20 -7.20 -3.90 -7.20 -1.40 -7.30 -7.20 -8.60 -7.20 
 -2.00 -2.00 -2.00 -1.00 -2.00 -2.00 -6.10 -2.00 -2.00  1.30 -2.00  3.80 -2.10 -2.00 -3.40 -2.00 
 -2.50 -2.50 -2.50 -1.50 -2.50 -2.50 -6.60 -2.50 -2.50  0.80 -2.50  3.30 -2.60 -2.50 -3.90 -2.50 
 -2.00 -2.00 -2.00 -1.00 -2.00 -2.00 -6.10 -2.00 -2.00  1.30 -2.00  3.80 -2.10 -2.00 -3.40 -2.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           A \/ \_/ T 
                                           T /\  |  G 
                                          3' <------ 5' 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -7.90 -7.90 -7.90-10.40 -7.90 -7.90-10.70 -7.90 -7.90 -3.50 -7.90 -3.80 -9.20 -7.90 -2.10 -7.90 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -8.40 -8.40 -8.40-10.90 -8.40 -8.40-11.20 -8.40 -8.40 -4.00 -8.40 -4.30 -9.70 -8.40 -2.60 -8.40 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -7.80 -7.80 -7.80-10.30 -7.80 -7.80-10.60 -7.80 -7.80 -3.40 -7.80 -3.70 -9.10 -7.80 -2.00 -7.80 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
  1.00  1.00  1.00 -1.50  1.00  1.00 -1.80  1.00  1.00  5.40  1.00  5.10 -0.30  1.00  6.80  1.00 
 -7.20 -7.20 -7.20 -9.70 -7.20 -7.20-10.00 -7.20 -7.20 -2.80 -7.20 -3.10 -8.50 -7.20 -1.40 -7.20 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 -2.50 -2.50 -2.50 -5.00 -2.50 -2.50 -5.30 -2.50 -2.50  1.90 -2.50  1.60 -3.80 -2.50  3.30 -2.50 
 -2.00 -2.00 -2.00 -4.50 -2.00 -2.00 -4.80 -2.00 -2.00  2.40 -2.00  2.10 -3.30 -2.00  3.80 -2.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           C \/ \_/ A 
                                           G /\  |  T 
                                          3' <------ 5' 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
-10.50-10.50-10.50-16.40-10.50-10.50-17.00-10.50-10.50-16.70-10.50 -9.80-15.70-10.50 -8.60-10.50 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
-10.00-10.00-10.00-15.90-10.00-10.00-16.50-10.00-10.00-16.20-10.00 -9.30-15.20-10.00 -8.10-10.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
-12.60-12.60-12.60-18.50-12.60-12.60-19.10-12.60-12.60-18.80-12.60-11.90-17.80-12.60-10.70-12.60 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -6.10 -6.10 -6.10-12.00 -6.10 -6.10-12.60 -6.10 -6.10-12.30 -6.10 -5.40-11.30 -6.10 -4.20 -6.10 
 -9.80 -9.80 -9.80-15.70 -9.80 -9.80-16.30 -9.80 -9.80-16.00 -9.80 -9.10-15.00 -9.80 -7.90 -9.80 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 -4.80 -4.80 -4.80-10.70 -4.80 -4.80-11.30 -4.80 -4.80-11.00 -4.80 -4.10-10.00 -4.80 -2.90 -4.80 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.90 -6.00 -6.00-12.50 -6.00 -6.00-12.20 -6.00 -5.30-11.20 -6.00 -4.10 -6.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           C \/ \_/ C 
                                           G /\  |  G 
                                          3' <------ 5' 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
-12.50-12.50-12.50-16.90-12.50-12.50-16.50-12.50-12.50-18.30-12.50-12.90-16.70-12.50 -5.20-12.50 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
-12.00-12.00-12.00-16.40-12.00-12.00-16.00-12.00-12.00-17.80-12.00-12.40-16.20-12.00 -4.70-12.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
-14.60-14.60-14.60-19.00-14.60-14.60-18.60-14.60-14.60-20.40-14.60-15.00-18.80-14.60 -7.30-14.60 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -8.10 -8.10 -8.10-12.50 -8.10 -8.10-12.10 -8.10 -8.10-13.90 -8.10 -8.50-12.30 -8.10 -0.80 -8.10 
-11.80-11.80-11.80-16.20-11.80-11.80-15.80-11.80-11.80-17.60-11.80-12.20-16.00-11.80 -4.50-11.80 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 -6.80 -6.80 -6.80-11.20 -6.80 -6.80-10.80 -6.80 -6.80-12.60 -6.80 -7.20-11.00 -6.80  0.50 -6.80 
 -8.00 -8.00 -8.00-12.40 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -8.00-13.80 -8.00 -8.40-12.20 -8.00 -0.70 -8.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           C \/ \_/ G 
                                           G /\  |  C 
                                          3' <------ 5' 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
-12.50-12.50-12.50-16.30-12.50-12.50-19.10-12.50-12.50-16.50-12.50-11.30-17.00-12.50-12.60-12.50 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
-12.00-12.00-12.00-15.80-12.00-12.00-18.60-12.00-12.00-16.00-12.00-10.80-16.50-12.00-12.10-12.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
-14.60-14.60-14.60-18.40-14.60-14.60-21.20-14.60-14.60-18.60-14.60-13.40-19.10-14.60-14.70-14.60 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -8.10 -8.10 -8.10-11.90 -8.10 -8.10-14.70 -8.10 -8.10-12.10 -8.10 -6.90-12.60 -8.10 -8.20 -8.10 
-11.80-11.80-11.80-15.60-11.80-11.80-18.40-11.80-11.80-15.80-11.80-10.60-16.30-11.80-11.90-11.80 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 -6.80 -6.80 -6.80-10.60 -6.80 -6.80-13.40 -6.80 -6.80-10.80 -6.80 -5.60-11.30 -6.80 -6.90 -6.80 
 -8.00 -8.00 -8.00-11.80 -8.00 -8.00-14.60 -8.00 -8.00-12.00 -8.00 -6.80-12.50 -8.00 -8.10 -8.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           C \/ \_/ T 
                                           G /\  |  A 
                                          3' <------ 5' 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
-10.50-10.50-10.50-15.70-10.50-10.50-16.30-10.50-10.50-16.90-10.50-11.00-16.40-10.50 -7.50-10.50 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
-10.00-10.00-10.00-15.20-10.00-10.00-15.80-10.00-10.00-16.40-10.00-10.50-15.90-10.00 -7.00-10.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
-12.60-12.60-12.60-17.80-12.60-12.60-18.40-12.60-12.60-19.00-12.60-13.10-18.50-12.60 -9.60-12.60 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -6.10 -6.10 -6.10-11.30 -6.10 -6.10-11.90 -6.10 -6.10-12.50 -6.10 -6.60-12.00 -6.10 -3.10 -6.10 
 -9.80 -9.80 -9.80-15.00 -9.80 -9.80-15.60 -9.80 -9.80-16.20 -9.80-10.30-15.70 -9.80 -6.80 -9.80 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 -4.80 -4.80 -4.80-10.00 -4.80 -4.80-10.60 -4.80 -4.80-11.20 -4.80 -5.30-10.70 -4.80 -1.80 -4.80 
 -6.00 -6.00 -6.00-11.20 -6.00 -6.00-11.80 -6.00 -6.00-12.40 -6.00 -6.50-11.90 -6.00 -3.00 -6.00 
 
                                               Y 
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
    A     A     A     A     C     C     C     C     G     G     G     G     T     T     T     T   
    A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T     A     C     G     T   
   --------------------------------------------------------------------------------------------- 
                                          5' ------> 3' 
                                           C \/ \_/ G 
                                           G /\  |  T 
                                          3' <------ 5' 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -8.50 -8.50 -8.50 -7.50 -8.50 -8.50-12.60 -8.50 -8.50 -5.20 -8.50 -2.70 -8.60 -8.50 -9.90 -8.50 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -8.00 -8.00 -8.00 -7.00 -8.00 -8.00-12.10 -8.00 -8.00 -4.70 -8.00 -2.20 -8.10 -8.00 -9.40 -8.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00 
 -4.00 -4.00 -4.00 -3.00 -4.00 -4.00 -8.10 -4.00 -4.00 -0.70 -4.00  1.80 -4.10 -4.00 -5.40 -4.00