addendum.html

这是一些经典算法的描述

    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>Hash table </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>Hash </strong><strong>表 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>一种数据结构，可以存储多个数值；不像矩阵要用整型索引获取存在其中的数， hash 表可以用任何类型的值（包括字符串）作为索引。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>Hidden Markov Models (HMM) </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>隐马尔柯夫模型（ HMM </strong><strong>） </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>在序列分析中常用的一种数学模型。 </p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>heterochromatin </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>异染色质 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>指转录停滞、紧密包裹着的染色质 ； 和高度 DNA 甲基化以及低度的组蛋白乙酰化有关。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>heuristic methods </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>启发式方法 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>反复试验 ， 利用经验解决问题的一种方法。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>homologs </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>同源 </strong><strong>序列 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>具有公共祖先的序列。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>horizontal </strong><strong>gene </strong><strong>transfer </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>基因水平转移 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>基因从一个物种传递到另一个物种的过程。虽然病原体和转座子通常被疑似为导致它的原因，但是基因这种运动的机制仍然未知。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>Human Genome Project, HGP</strong><strong>&nbsp; </strong></p>    </td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>人类基因组计划 </strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>通过全球合作，绘制人类基因组的全部序列图谱。 </p></td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>housekeeping gene </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>管家基因 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>发育过程中在任何时间、在任何器官都高度表达的基因。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>H-P (hydrophobic-polar) model </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>H-P </strong><strong>（疏水极性）模型 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>以固定半径的单个原子表示蛋白质中的一个氨基酸残基的简单网格模型。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>hydrogen bonding </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>氢键 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>由于极性共价键的作用，使得电荷作用发生轻微分离而形成的分子相互作用。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>hydrophilic </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>亲水的 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>很容易在水性溶剂中溶解；字面上理解，就是和水易处的。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>hydrophobic </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>疏水的 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>难以和 水分子相互作用，字面上就是厌水的。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>hydrophobic amino acid </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>疏水氨基酸 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>含有一个全部由碳和氢组成的 R 基团 的氨基酸；它不可能和水分子形成氢键</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>hydrophobic collapse </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>疏水折叠 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>将一个多肽链折叠成一个压缩的构象，从而使疏水残基远离溶剂的过程，简单的说，是由疏水作用而引起的肽链折叠。</p>    </td>
  </tr>
</table>
<p align="center" class="Wdy_Character1"><a name="MarkI"></a>I</p>
<table border="3" align="center" cellpadding="0" cellspacing="0" bordercolor="#EFCE8F">
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>indel </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>插入或删除 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>插入或删除。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>inferred ancestor 25 </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>推断祖先 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>通过 系统发生树推断而得到的祖先。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>inferred tree </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>推断树 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>对三个或三个以上的同源序列的系统发生关系的描述，是它们真正关系的一个近似。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>informative </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>有信息 </strong><strong>（ </strong><strong>位点 </strong><strong>） </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>在简约性分析中的提供有用信息位点 ； 与此对应的是无信息位点。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>ingroup </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>内群（或内部物种） </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>一个物种或一个分歧不大的物种系列；与此相对应的是外群。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>Inhibitor </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>抑制剂 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>任何可以降低酶促反应速度的物质。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>initiation complex </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>起始复合物 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>一系列自身相互作用的转录因子形成复合体 ， 作用与一个基因的启动子区域 ， 从而促进基因的转录启动。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>initiator (Inr) sequence </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>起始序列 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>真核基因中与 转录起始位点密切相关的核苷酸 ； 在人类中 ， 该一致序列是 5'-YYCARR-3' 。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>insertion sequence </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>插入序列 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>指除了自身转座需要外不再包含有任何信息的 转座子元件 ； 当被插入到一个基因中 ， 它将破坏其正常的结构以及基因的功能。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>internal node </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>内部节点 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>在一棵 系统发生树中 ， 不对应真正数据的节点 ， 这样的节点代表两个或多个独立家系的公共祖先。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>intrinsic terminator </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>固有终止子 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>在原核生物中终止转录的特殊信号 ； 指在新转录的 RNA 中可以形成二级结构的核苷酸序列 ， 其后跟随一串尿嘧啶。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="45" align="center" valign="middle"><p><strong>intron </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>内含子 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>在剪切时被切除的内部序列；出现在真核基因的 初级转录物 (hnRNAs) 中， 而不是在 mRNA 中。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>isochores </strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>等值区 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>在真核基因组中具有相似碱基比例的区域。</p>    </td>
  </tr>
</table>
<p align="center" class="Wdy_Character1"><a name="MarkJ"></a>J</p>
<table border="3" align="center" cellpadding="0" cellspacing="0" bordercolor="#EFCE8F">
  <tr align="center" valign="middle">
    <td width="170" height="25"><p><strong>junk DNA </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170"><p><strong>垃圾 </strong><strong>DNA </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450"><p>没有意义的 DNA 序列；也指那些目前还不知道其作用的序列。</p>    </td>
  </tr>
</table>
<p align="center" class="Wdy_Character1"><a name="MarkK"></a>K</p>
<table border="3" align="center" cellpadding="0" cellspacing="0" bordercolor="#EFCE8F">
  <tr align="center" valign="middle">
    <td width="170" height="25"><p><strong>kilobase(kb) </strong></p></td>
    <td width="170"><p><strong>千碱基 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450"><p>DNA 序列的长度单位 ， 1000 个碱基为 1kb 。</p>    </td>
  </tr>
</table>
<p align="center" class="Wdy_Character1"><a name="MarkL"></a>L</p>
<table border="3" align="center" cellpadding="0" cellspacing="0" bordercolor="#EFCE8F">
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>lead compound </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>先导化合物 </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>指在药物设计中一个可行的候选分子。</p>    </td>
  </tr>
  <tr>
    <td width="170" height="25" align="center" valign="middle"><p><strong>LINE </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="170" align="center" valign="middle"><p><strong>LINE </strong><strong></strong></p></td>
    <td width="450" align="center" valign="middle"><p>长散布（核）元件。</p>    </td>