bz_hit19.h

一个类似于blast算法的基因数据快速搜索算法

/* $Id: bz_hit19.h,v 1.3 2003/01/09 19:33:56 schwartz Exp $ */
blast_table_t *blast_1219_new(SEQ *seq, int W);
void blast_1219_free(blast_table_t *bt);
msp_table_t *blast_1219_search(SEQ *seq1, SEQ *seq2, blast_table_t *bt, msp_table_t *mt, ss_t ss, int X, int K, int P, int T);